Basic Information

Symbol
TNFSF15
RNA class
mRNA
Alias
TNF Superfamily Member 15 VEGI TL1 Vascular Endothelial Cell Growth Inhibitor TNF Ligand-Related Molecule 1 VEGI192A TL1A Tumor Necrosis Factor (Ligand) Superfamily, Member 15 Tumor Necrosis Factor Ligand Superfamily Member 15 Vascular Endothelial Growth Inhibitor-192A Vascular Endothelial Growth Inhibitor TNF Superfamily Ligand TL1A MGC129934 MGC129935 Tumor Necrosis Factor Superfamily Member 15 Tumor Necrosis Factor Ligand 1B TNLG1B
Location (GRCh38)
9:114784652-114806039
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005118.4
Sequence length
6583.0 nt
GC content
0.4235

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2080.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2196.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1477.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204344.1 NCBI
AUGCAACUCACAAAGGGCCGUCUUCAUUUCAGUCACCCUUUGUCUCAUA… 6412 nt 0.4142
NM_005118.4 NCBI
AGAGGUGCCUCCAGGAGCAGCAGGAGCAUGGCCGAGGAUCUGGGACUGA… 6583 nt 0.4235
Summary

The protein encoded by this gene is a cytokine that belongs to the tumor necrosis factor (TNF) ligand family. This protein is abundantly expressed in endothelial cells, but is not expressed in either B or T cells. The expression of this protein is inducible by TNF and IL-1 alpha. This cytokine is a ligand for receptor TNFRSF25 and decoy receptor TNFRSF21/DR6. It can activate NF-kappaB and MAP kinases, and acts as an autocrine factor to induce apoptosis in endothelial cells. This cytokine is also found to inhibit endothelial cell proliferation, and thus may function as an angiogenesis inhibitor. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the TNFSF15 as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].