Basic Information

Symbol
BICC1
RNA class
mRNA
Alias
BicC Family RNA Binding Protein 1 Protein Bicaudal C Homolog 1 Bicaudal C Homolog 1 (Drosophila) FGFR2-BICC1 Fusion Kinase Protein Bicaudal C Homolog 1 Bic-C BICC
Location (GRCh38)
10:58512872-58831435
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001080512.3
Sequence length
5741.0 nt
GC content
0.4337

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1671.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1780.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1351.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001080512.3 NCBI
AUUCCGCGCGGGCGUUGCUGGCGGGGGGCGGCGCAGCCACUGGACCCGG… 5741 nt 0.4337
Summary

This gene encodes an RNA-binding protein that is active in regulating gene expression by modulating protein translation during embryonic development. Mouse studies identified the corresponding protein to be under strict control during cell differentiation and to be a maternally provided gene product. [provided by RefSeq, Apr 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the BICC1 is part of a 38-gene transcriptomic signature of obesity, with a positive coefficient of 0.0638, and its expression in subcutaneous adipose tissue strongly correlates with body mass index (BMI) and fat mass [Francesc Font-Clos et al. DOI:10.1088/1361-6579/aab85a].