Basic Information

Symbol
TNR
RNA class
mRNA
Alias
Tenascin R Restrictin Janusin Tenascin-R TN-R NEDSTO
Location (GRCh38)
1:175315194-175743595
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003285.3
Sequence length
12774.0 nt
GC content
0.4822

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4117.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4356.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2865.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001328635.2 NCBI
ACGUCAGAGGCAGGAACCGACUGUGCUAAGGCUGUUGGCUCAACACCCA… 12670 nt 0.4815
NM_003285.3 NCBI
ACGUCAGAGGCAGGAACCGACUGUGCUAAGGCUGUUGGCUCAACACCCA… 12774 nt 0.4822
Summary

This gene encodes a member of the tenascin family of extracellular matrix glycoproteins. The encoded protein is restricted to the central nervous system. The protein may play a role in neurite outgrowth, neural cell adhesion and modulation of sodium channel function. It is a constituent of perineuronal nets. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

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