Basic Information

Symbol
BICRAL
RNA class
mRNA
Alias
BICRA Like Chromatin Remodeling Complex Associated Protein KIAA0240 GLTSCR1L SMARCK2 BRD4 Interacting Chromatin Remodeling Complex Associated Protein Like BRD4-Interacting Chromatin-Remodeling Complex-Associated Protein-Like Glioma Tumor Suppressor Candidate Region Gene 1 Protein-Like GLTSCR1 Like BRD4 Interacting Chromatin Remodelling Complex Associated Protein Like GLTSCR1-Like
Location (GRCh38)
6:42781931-42868560
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001393499.1
Sequence length
6501.0 nt
GC content
0.4375

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1811.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1933.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1507.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318819.2 NCBI
ACUCCCUCCGCAGCUGGGCGUCGCCGGCCGCGCUGGGGCGAGAACCGAA… 6751 nt 0.4513
NM_001393499.1 NCBI
GUUGCGAUGGCGCAGAAACCCCGUUGACAAGGCACUGCUUUUUCAUGAC… 6501 nt 0.4375
NM_015349.3 NCBI
GGCAUCUUUUCAGGAUUUCAUUCCUACGUCCAACUGCCGUUCACAACUG… 6513 nt 0.4385
Summary

Predicted to be involved in positive regulation of DNA-templated transcription. Part of SWI/SNF complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human blood samples stored at 4°C demonstrated that the BICRAL was identified as one of 13 downregulated transcripts overlapping with important variables in a random forest model for predicting the time since deposition (TSD) of bloodstains [Zhang et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2024.111930]. This model, based on transcriptomic changes, successfully predicted TSD with high accuracy (AUC=0.995, precision=1, recall=1), classifying samples into four distinct degradation stages from 0 to 168 days.