Basic Information

Symbol
TPST1
RNA class
mRNA
Alias
Tyrosylprotein Sulfotransferase 1 TANGO13A Protein-Tyrosine Sulfotransferase 1 EC 2.8.2.20 TPST-1 Transport And Golgi Organization 13 Homolog A (Drosophila) Transport And Golgi Organization 13 Homolog A
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_003596.4
Sequence length
1981.0 nt
GC content
0.4664

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-639.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -678.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 512.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((.....))))(((.(((((((.(((((((.((((.((((...)))).)))).))).)))).)))))))..)))((((.(((.((((((((((((.......)))))(((((((....)))))))((((((((.((((...((((.((((((..(....)..))))))))))..)))).)).....))))))....((((.((((.((((((((((.((.(((.....((((((...((((((((((......((((((((....))).)))))......))))))))))))))))((....))....(((((..(((((.(((((((((((..((((((((.(((.((((.....))))))).....))))))))...)))))))))))((((..((..((((((((((...)))))....((((.(.....)))))....))))).))..))))...)))))......(((((.......))))).((((((((((((....))))))))))))....((((((((.((...(((((((((.(((.((((..((.(((.(((..(((((.((((((.(((((((((((((((((((...)))...))))))))..(((.(.((((.(.((((((((.....(((...((((((((((.(((((((((((((((........(((((.((((.((((((.(((.((((....))))......)))..)))))))))))))))(((((((...........((((((((((((((.(..((((((((((((......))))))).........((((....((....))))))..)))))..).)))))..(((...(((((((((((.(((((.(((..(((((((((.............)))))))))..))).)))))....((((..((........))..))))......(((.....))).(((((((......(((.(((.((((.((((...)))))))).)))))).(((((........)))))((((((((((....(((((............)))))..((((((.((.((.(((......)))..)).))..))))))))))))).))).......(((((....)))))...((((((...(((((........((((((((...((((....((..(......)..))((((..(((((....)))))))))..)))).)))))))))))))....))))))(((((...))))))))))))...........(((........)))..)))))))))))...))).))))))))))))))))...................(((((...)))))..((((...........))))))))))...)))...)))))).))))...............(((((......)))))...((((...))))(((.(((((........))))).)))))))))...)))....)))))))).))))).).)))........))))))))))))..)).))))).)))))).))..))))..))).))))))))))).)))).)))).((((.....))))..((((((.((((.......((((((((((..(((((......((((((....).))))).......))))).)))).((((((....(((..........)))....))))))))))))...))))))))))..)))))))).)))))))))))).)))).))))(((((((...((((((((((((........)))))))..))))).....(((((((((((((((.....))))))(((.((((((((.((((...((......))....)))).)))))))).)))......))))))))))))))))...((....)).((((((((....))))))))))))))).))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{(((,,...|}||{(,.(((((((.(((((({.((((.((((...)))).)))).})).)))).)))))))..)})((((.(({.((((((((((((.....,.)))))(((((((....)))))))((((((((.((((...((((.(((((({.{....,,,))))))))))..)))).)).....))))))....((((.((((.((((((((((.({.(((..{,{((((({..,((((((((((......((((((((....))),}))))......))))))))))))))))|,{{..{|{{,..,,....(((((.(((((((((((..((((((((.((({((({.....}))},}))),}.))))))))...)))))))))))((((..((..((((((((((...}))))....((({.{.....}))))....))))).))..))))...)))))......{||||,...,,.}}}}|.{(((((((((((....)))))))))))).,,.((((((((.((...(((((((((.(((.((((..((.(((.(((..(((((.({((((.(((((((((((((((({{{...}}}...))))))))..((({({(((({{.((((((((....,({{.,.(({(((({{{.{|{((((((((((((({,,{,{.(((((.((((.((((((.,{{.((((....)))}......}}}..))))))))))))))),,|||||,...}},,|{{((((,,(({,,,,,.|,,}}}}}||,,,,({{{...,)))),,...{{,...((((..{{{(.((....))...)))))))).)))))}}|||,,,||{|{{{{(({,(((({.(((,.(((((((((.............))))))))).,))).})))}....{(((..((........))..))}}.{(({{(((({.,..,,.,||||||}}}}..{((.(((.(((,{((({...}))))))).)))))).{((((........))))|(({{((((({....((((({,{,..,,.,,,}}},}..{(({{{.,{.,.||||,.....,},..})))},.))))))))))))))))}}}}....(((((....))))).,,||,{{{..,{{.(({{{{{,.{((((({(((((((({,....(({.((,..,,,,|}((({.|(((({....})))))))).,}}}||||||||,,|{|||,.,,|}||||({{{{.,,|,}}||}}}|||,.,........(({........}}}..,,,,,,||||,.....),)),))))})}}},|||,,...,}},.,,.,,|,.,(({((...}}}},..,,,,,,..},.},}}))))}))))},..,}}|,,||}|||,||},.......||,..,.,{{||{,,....}}}}}}.||{{....)))),||.|||||,,,,,,,.)))}}.}))))))))}}.))),},.}))))))).))})),,.}))}}}}}}..))))))))))))..}).))))).)))))).))..))))..))).))))))))))).)))),}))).((((.....))))..(((((({.{{{..{{{,.,{{{{||||,..(((((......((((((....)}))))).......))))).||}}.((((((,,,.(((..........)))....))))))))))}},.,,},))))))),}}}..,))).),)))))))))).)))).))))((((((({..((((((((((((........)))))}},}))))).....,((((((({{(((({,,,,.,,,|||{{{,{{{{{{{|,|||||..{{......}}.,|,|}}}.}})))))),})},,})))))))))))))))))))...,{....}}.{(((((({....)))))))}))))))).})).)))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGACGCUGCUGAGGCGGCUUCGGUUGCGGGUCGGAACGGCGCUGCUCUG… 1981 nt 0.4664
Summary

Enables protein homodimerization activity and protein-tyrosine sulfotransferase activity. Involved in post-translational protein modification. Located in Golgi membrane. Implicated in colorectal adenocarcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the TPST1 was upregulated during long-term weight loss (0 to 12 months) in weight losers within subcutaneous adipose tissue [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].