Basic Information

Symbol
AANAT
RNA class
mRNA
Alias
Aralkylamine N-Acetyltransferase SNAT Serotonin N-Acetyltransferase Arylalkylamine N-Acetyltransferase Serotonin Acetylase EC 2.3.1.87 AA-NAT DSPS
Location (GRCh38)
17:76452749-76470122
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001088.3
Sequence length
971.0 nt
GC content
0.6416

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-428.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -443.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001088.3 NCBI
GAACAUCUGCUACUACAGCCUUGCAGCCCGGAGUCCCGGAUUUUACUGG… 971 nt 0.6416
NM_001166579.2 NCBI
AUGGAAUCCACUAAGAAGGGGCGAGACCAGUGAGGAUUCAACUAAAGGG… 1913 nt 0.5855
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the acetyltransferase superfamily. It is the penultimate enzyme in melatonin synthesis and controls the night/day rhythm in melatonin production in the vertebrate pineal gland. Melatonin is essential for the function of the circadian clock that influences activity and sleep. This enzyme is regulated by cAMP-dependent phosphorylation that promotes its interaction with 14-3-3 proteins and thus protects the enzyme against proteasomal degradation. This gene may contribute to numerous genetic diseases such as delayed sleep phase syndrome. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in humans using RNA-seq and scRNA-seq data from peripheral blood mononuclear cells and whole blood samples identified multiple differentially expressed circadian rhythm-related genes in sepsis patients versus controls, including the AANAT which was analyzed but showed no significant differential expression in subsequent RT-qPCR validation on samples from 10 patients and 10 healthy individuals [Wang et al. DOI:10.3390/ijms26093993].