Basic Information

Symbol
TRAM2
RNA class
mRNA
Alias
Translocation Associated Membrane Protein 2 KIAA0057 Translocating Chain-Associated Membrane Protein 2 TRAM-Like Protein
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_012288.4
Sequence length
7047.0 nt
GC content
0.5022

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2409.41 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2535.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1709.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((..(((((.....)))))..)))((((((((((((((.((((((((((((((((.(((.(.(((((.(((((........((((((((((...))).)))))))))))).))))).)))).))))))...))))))))))...)))))))....(((((((...(((.(((.((.....((((.((.(((((.(((........)))))))).))))))...))..))))))...))))))).((((((....))))))...)))))))....((((((((.(((((((((((....(((((...........(((.((((.((((((((.((((((.(((((((((((((((....((((..((((........(((...)))........))))...))))....))))))....((((((((.....((((...((((((....(((((..........)))))...........(((((.......))))).)))))).))))..((..((((....))))..))))))))))..)))))))))))))(((....))).......((((((.((....((((((((.((((((....))...((((((((((((((((....))).)))).(((..((.((((....))))))..)))((((..(((......)))..))))....)))))).)))..((((((.(((((((((((((((.((((.......)))).)))).))))))))..(((((..((((...(((.(((((((((((((((((((((....)))).((((....))))...((.((..((.((.((((....)))))).))..)).))......)))))......)))).)))))))).)))))))..)))))..((((((..................((((((.(((((.(........).))))).))))))(((((.(((...((((((((......))))...))))..))).)))))((((...))))(((((((.(((((.(((((((((...(((...)))...))))))).......))..))))).))))))).))))))......((...(((((((((...((((((((((..(((((((...(((((..((((((((((........(((((.....(((..((.(((....((((.((.(((((.((((..((((((.(((((...((((..........))))(((((....(((...(((.((((.((((..((.....((.((((((.(.(.(((((((..((...))..))))))).)).)))))).))...(((..((.((((...)))).))..)))..))..))))))))))).))))))))))))).))))))))))))))).))(((((((...............................)))))))..............))))...)))))..))).....)))))........)))).))))).)..)))))..(((...)))....)))))))...)))))))))))))))).)))...)).((((((.(.(((((((((((.....(((((...............((((((((((((.(((.(((.....))).))).))))....))))))))(.((........)).).((.((((((((((((((((....)))..))))))))))))).))((((((..((((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((........))))).))))).)))))))).))..((((.(((.((.......)).)))))))(((((((..(((((...(.(((((((.....))))))).)....)))))...((((....))))((((.((.((((((((.(...).)))).)))).)).))))...(((((((((((((.((.(((...(((((((.((((((((((((((((((....))))))).))))..))))))).))))).))(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...........(((((...............))))).........)))))))))))))))).....((((.(((((((((((.......(((((((((.(((((....(((.((((((...(((((((.((.......)).))))))).(((((....)))))...............(((((....(((......)))......)))))(((((((..(((((.....))))).)))))))..)))))).)))......))))).))))))....))).........))))))))...)))))))((((((((((..(((.(..((((..((.....((((.(((((((..((((...(((.((((.....)))).))).(((((((((((........((((((((((((((.................(((........)))(((((..(((((....))))).))))))))))).......))))))))....((((........((((((........)))))).......))))..))))))))))).((((.(((((.(((((.((((((((....(((((((.(((((((.(((...)))...)))))))..)).)))))...))))))))..((((............))))(.((((((((((((.(..(.((..(((((((...((((((((((((((...(((......(((((((...((((((((((((((.(((.(((((((((.(((.(((......))))))))))...((((((((((.((((((...........((.((.(((((((((((((...(((......))).......))))..))))))))).)).)).......((((((..(((((((....((((..(((..(((......))).))).))))....((((((....))))))((((((((......(((((......)))))..)))))))).)))))))))).)))....)))))))))))).))))....(((((((((((((..((((((..........))))))....)))))))..........))))))(((((((((((((((.(((...))).))))))...........((((((...(((.(((((....)))))))))))))))))))))))...)))))))).))).))(((.((((((((((.((((......)))))))...((((((...((((((....((((((.((......))((((((((.((((((((.((((........))))))))).........((((.((((..........))))...))))((.....))..((((((((.((...(((((..(((((((.(((((..((.((((((((((((((((...(.(((((((((.((((((((.(((((.(((((((........)))))))......(((.((.(((((.....((((((((....((((....((.(.(((((.(((((.((((......))))))))))))))).)).((((((((((.((((((((((..(((((((((..((((((((((......)))....................)))))))..)))))))))......))))).((((.......)))).........(((((....((((((((((((((((((((((...))))).....(((((((...((((...))))..)))).))).))))..))))).(((((((((..((((.(((.(((((.((..(((((((.((((.(((................))).))))))))))).(..((..((((.(((((((((...)))))))))..))))..))..)....((((((((.(((.(.((((((.((...)).)))))).).)))))))))))...))))))))))))))..............))))))))).((((((((.........))))))))(((((((..(((((.............((((..((..(((.(((((.(((.(((((...(.(((((((((.((((((((((.......)))......(((........))).)))))))))))))..))).)...)))))..))).))))))))..))..))))))))).)))....)))).....))))))))...)))))..)))).).)))))))))).)))).)))))))).))))))).)))..(((((....)))))...)))))..))))))))((((((.(((.(.((((((((.(((.........))).))))))))).))).)))))))))))).))).)...))))).(((((((....((....)).....)))))))(((............)))..))))))..))))).))..))))).)))...))))...))))).)).)))))))).))))))))))).((((..(((......))).)))).......((((.((.((((((....))))))))..)))))))))).))))))...))))))(((((....)))))....((((((.....((((.((((((..(((((((((..(((.((...((.(((.(((......)))))).)).....)).)))((((((((...........))))))))))).)))).))..)))))).))))))))))........(((.(((((((((((.......(((((........((((..(((((........)))))))))((((((......................))).))).))))).....))))).))).))).)))........))))))).)))))))))))))))))))..)))...)))))))))))))))))))))..)).)..))))))..(((((((((.(((((((((((((.........((((......))))(((...)))....))))....((((((..((((((((((...(((.(((.(((((...)))))))).)))...)))......)))))))...))))))..........(((((((....(((((((.....(((.((((((((...))))))))...)))......)))))))....(((((((....)))))))(((.(((((.....(((......)))......))))).))).))))))).))))))).)).)))))))))......))))))).)....((((....)))).))))).))))))))).....(((((.((......)).)))))..))))..))))))).))))...))..))))..).)))..)))))))).))(((((((....(((((.((.((.(((..........))).))...)).)))))....)))))))((((...((((....)))))))).)).))).....)))))......)))))))))))))....))).)).)))))))))))))..(((((((((((((....((((((((..((....(((.((((((((((......))))..((((((.((((..((((((((((((.(.(((............((((.((((.......))))..)))).(((..(((....(((((.((((((((..(((.(((((.......))))).))).(((((((((((((..(((........)))....)))).))).))))))....)))))))).)))))...)))....)))...(((.((((...((((..((((((((((.....((((...................................)))).((((((((.((.(((......))).....(((((((.((........(((((..((((.......))))..)))))..(((((...((((((((((((........((((((((((..((((.(....)))))..)))..((.(((.(((....(((((((..((((((((((((((.(((((.(((((((.(((.(((((.((((...................)))).).))))...(((((((((.(((((.........((((.....)))).........)).)))...)))))))))..((((...))))))).))))))).......(((...(((((((((((((............)))))..)))))))).....))).))))).))))))).......))))))).)))))))....)))))).))............)))))))...(((((........)))))(((((((........)))))))..(((....(((.((((((((((.......))))).))))).))).)))...))))))...((((.....))))...))))))))))).......)).)))))))..)).))))))))(((.(((((((.....)))))))))).))))))(((((............))))).....))))..))))...)))).)))))).).))))))))......))))..)))))))))).(((((....))))).))).))))))..))..))))))))..)))))).))))))).....)))...)))).....))).)))))))))..))).))))))))))))))))))..........)))))...))))))))...))).).))))))...((.((((........)))).)))))))))))))))))))))))))))))))((((......))))..........))))))))))))))..)))..((((((........))))))....(((((((((((.......))))))).....))))..)))))...)))))))..)))))))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((,.(((((.....))))),.)))((((((((((((((.((((((((((((((((.(((.(.(((((.(((((........((((((((((...))).)))))))))))).))))).)))).))))))...))))))))))...)))))))...(((.(((((.......,,.(({,,,.,||.,}}}|)))))).}))......{{((((((((((((....))).)))).)))))))||||.((((((....))))))}}.)))))))....((((((((.{{{{{{{{{((....,|||,..,......,,(((.((((.((((((((.({((((.(((((((((,,,((({...{{{{{.,(({.....,,.{||.}|||,........||||.,,,,.,,..|},|)))},..{(((({{{.....,{{{...,,,{((....,|||,.,,,,.,,,,,||,|..,|.||||..||{,{.,},...)))}}.)}}))).},}},,((..((((....))))..)))})))}})..)))))))))))))(((....)))......,(({((({((....{(((((((.((((((....))..(((((({,,{(((((((....})).)))).(((..((,(({{...,))))))..))},((({{(((......||||.||||{|{.||||||{||{,{,,{{((((((((((((((((((.((((.......)))).))))}})))))))..(((((..((((...(((.((((((((((((.{.{(((((....)))))|(((....)))}...((,,(..{{.|{.((({....})))}}.}).,)).)}......,}}},....,.)))).)))))))).)))))))..)))))..{{{(((..................((((((.(((((.,.......,}.))))).)))))){((((.{((...{(((((((......))))...)))}..})}.))))}((((...))))(((((((.(((((.({(((((((...(((...)))...))))))}..,,..,}}..))))).))))))),))))))......((...(((((((((...(((((((((({.(((((((...(((((..{(((((((((..,,.,,{(((((....,((({....(((..((((((((,.,,((((((,(((.(((.,,((({{..{((((..,....,..))))}.....,||{,....|{(|{((,.{(((...,.}}}}||}((((((.(.(.(((((((..((...))..)))))))}}).))))))}))}}}|||}}|,.,,||}}}))),}))..,)),,),..}))}))))),,.,|||||||||{((((...))))}}}},,,,..{((((({...........................,...})))))}..............}}))}}},{(((......}))),,,,,......).)))).))))).}..)))))..(((...)))....))))))).}.)))))))))))))))).)))...}}...,|||.{,.||||||||||....}|||||||},,,........,{(((((((((((.(((.(({.....))).))).)))),...})))))))}.,|,,,||,,,||.|{{(,((((((((((((((((....))}.,))))))))))))).)){(((({.,((((((((((((.((((((((((((.(((,{.(((((((((((((.(((((........))))).))))).)))))))),||..((((.(((.((.......)).)))))))(((({{{..(((((...{.(((((((.....))))))).}..,.)))))...{(((....))))((((.((.((((((((,(...}.}))).)))).)).)))).{.(((((((((((((.((.(((...(((((((.((((((((((((((((({....))))))).))})..))))))).))))).)){{(((((((((((((((({{{,,((((((((((((((((.{.........(((((,,.......}.....)))))...}},...)))))))))))))))),.,,,(({(,({{((((((({.......(((((((((.(((((....(((.((((((,,.(((((((.((,......,),))))))).(((((....)))))...............({(({..,,{{,....,.))}...,..})))},((((((..(((((.....))))).))))))),.)))))).))),,.,..))))).))))))....)))......,,,})))))))}..,)))}}},|((((((((..(((.{..{{{{..({....,((((,(((({{{.,{{({..,(((.((((.....)))).))}.(((((((((((........((((((((((((((,,......,,..,,,..{{{.....,..))){((((..(((((....))))).))))))))))).......))))))))....((((.......,((((((........)))))).......))))..))))))))))).((((.(((((.(((((.((((((((....(((((((.(((((((.(({...}))...)))))))..)).)))))...))))))))..{{{,............,}}}(.((((((((((((.{..(.{(..(((((((...((((((((((((((..,{({..,...(((((((..,((((((((({((((.(,,(((((.{(((.(((.(((......)))))))))}..{((,,{{..,|}|{|||............,{.,,..,,.,|,,,}|}}}..|.}}}|{{{,{{{{{{{{{||,|,.|||||||||,|{{{{{{,..,{(.((((({(,{{(({.{{{(((({,.,,..,|}}}....)))})||.,|||,...{(((({....}}}}}},{((((((({{{{{(,,{,...{,,|||||{{{|,|,|||.,,,}|||,,,,.,,....,}}},....,,|,{{{{{{{{((((({(((((((..((((((..........))))))....)))))))..........)))))),{{,,||||||||||,|{{...))),))))))}},........((((((,..{{,,{((({....})))))}))))))))))))))))}}}}}},,}}}}}))}))}|,,|||||,||||}}.}},|,{{{(||(((...{((((((...((({((...,(((((({((,,(,,({((({,,,,{{(,,(((((.((((........))))))))),,....,,,|,,|}|||,{{{{{.,,.,||,,......|||,,...}},.((((((((.((..{(((((..(((((((.(((((,,((.{{(({(((((((((((...(.(((((((((.((((((((.(((((.(((((((.......,))))))}{{(,{{((({((,(((((.....((((((((....{{{{.,.|||,,.{((((.(((((.((((......))))))))))))))},}|,((((((((((.{{(((((((((.(((((((((..((((((({((....,.{{{.............}),.,)})))))))..)))))))||,.,.{{,|||,.{{||}},.,.|)))),}},.,.,.,{{((,,{{{(((((({{((({((((({(((,..|||}}.....({{{(((..,((({...}))}..)}}),))),))))..})))}.(((((((((....{(((((,({{(({(({.(((((((.((((.(((................))),))),))))))).{..((.{((((.(((((((({...})))))))).,})))))}),.,....((((((((((({.((,(((.({.....((((,,....,.)))),,)))))})}))))))))))))))))))}}},,},,,,))))))))).((((((((.,.....,.))))))))((({(({..(((((|{......,,...{(((..((..(((.(((({.(((.(((((...{.{({{(((({,((((((((((.......)))......(((........))).))))))))))))}..}}}.}...)))))..))).))))))))..))..))))))))).)))....))},,,,},)))))}))...))}))..)))),),)))))))))).)))}.)))))))).)))))},..,,.,|||||..,,)}))),..)))))..)))))))){(((((.(((.(.((((((((.(((.........))).))))))))).))).)))))))))))).))).)...)))))}(((((((....((....}),....)))))))(((...,......,.)))..,))))),,}}))}.))..))))).)),..})))).,,})))).)).)))))))).))}))))).)))}|||}.(((......))),}|||....,,,||||,|{.((((((....))))))}...}}))}})))),}}}}},,{{||{{{.(((((....)))))..,.,,...........|}.,,,..},,}}}}},..))))))).))))))}||{.(((....}}),,}},..((({..((((((({{{,,,{.,{{{{.....,,,)))))(((.(((((({,,{((((((((....))))))}),........{((((((((((.{,.,{....|,..},.})))))..)))}}..})))})))).})}})))))).))))...........,,,,.((((((.,|,....,....)))))),|||||,},)))))}))).))))),)),,,))))))))))))))))),,,))...)))))))))))))))))))))..)}.}..)))))){.(((((((((.(((((((((((((....,...,{,(({{((({((((((...,|(({...,})).,.,((,(((,..,||||,}}|...(((.(((.(((((...)))))))).)))....))))}})))}))))).,,))}}))))........(((((((..,,(((((((..,..(((.((((((((...))))))))...}))......)))))))....(((((((....)))))))(((.{((((.....(((......)))...,..))))}.})).))))))).))))))).)).))))))))).,....))))))).}....((((....)))).))))).))))))))).....{{{{{,{{..,,,.)}.}))))..})}}..})))))),)))}..,))},)))),.}.)))..))))))))||,{((((((....(((((.((.((.(((..........))).))...)).)))))....)))))))||{|,..{{{|,...)))),})).}),)}}.....)))))}.....}))))))))))))....})).}}.)))))))))))))..(((((((((((((....((((((((..((....(((.((((((,((,.,..,,}}|,..((((((.((((..((((((((((((...,,,.........{{.((((.((((.......))))..)))).)}|,,(((....(((({.((((((((..,((.(((((.......))))).))}.(((((((((((((..(((........)))....)))),,)).))))))....)))))))).)))))...)))....{{{...(((.((((...((((..((((((((((.............,..................,,..........,,||.((((((((.((.(((......))).....{((((((.{{........{{{{{..{{{{...,,,,||}}..))))),,(((((...((((((((((((,{{{{,,.,{{{{{,(((.,((((.(....))))).,)))..((.(({,(((....(((((((..((((((((((((((.(((((.{{((({{.{{{.{((((.((((...................)))).).)))}..,((((((({{,((({({,,,.....{{{{...,,||}|,,,......},..}}...}}))))})),,|{||,,,)}})))}.))))))),......{(,...(((((((((({((.{..........))}))..)))))))).....))).))))).))))))).......))))))).)))))))....)))))).))............)))))))...(((((........)))))(((((((........)))))))..{{{....(((.((((((((((,....,.))))),,)))).))).}}}...})))))...((((.....))))...))))))))))).......}).))))))}..)).)))))))){{{{(((((((.....)))))))))).))))))(((((............))))).....))))..))))...)))).))),.)}).)))))))),.....})))..)))))))))).{{{{{....,)))}.)))}})))))..))..))))))))..)))))).))))))).....))}...)))).....))).)))))))))..))).)))))))))))))))))}..........,))))}},}))))),,...,},||.|((.{.{((.(((......))),)),).))).)))))))))))))))))))})))))))){(({......,))),,,.......)}))))))))))))..))).,{{((({....,,,,,,}}))}|,..,,,|}}}}}}||,.,{{{{{||||.,|||}.....,}}}},,}))))))},.,}}})))))))).......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAAGUUGUUCCGCGCUGGGCGGGCGAGCGGCUGUGGGAGAGCGGGCGGC… 7047 nt 0.5022
Summary

TRAM2 is a component of the translocon, a gated macromolecular channel that controls the posttranslational processing of nascent secretory and membrane proteins at the endoplasmic reticulum (ER) membrane.[supplied by OMIM, Jul 2004]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.