Basic Information

Symbol
TRAP1
RNA class
mRNA
Alias
TNF Receptor Associated Protein 1 HSP75 HSP90L Tumor Necrosis Factor Type 1 Receptor-Associated Protein Heat Shock Protein 75 KDa, Mitochondrial Heat Shock Protein Family C Member 5 TNFR-Associated Protein 1 HSP 75 TRAP-1 TNF Receptor-Associated Protein 1 Testicular Tissue Protein Li 209 HSPC5
Location (GRCh38)
16:3651639-3717591
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016292.3
Sequence length
2223.0 nt
GC content
0.5753

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-869.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -903.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 394.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001272049.2 NCBI
GCUCUGGGAGUACGACAUGGCGCGCGAGCUGCGGGCGCUGCUGCUGUGG… 2064 nt 0.5727
NM_016292.3 NCBI
GCUCUGGGAGUACGACAUGGCGCGCGAGCUGCGGGCGCUGCUGCUGUGG… 2223 nt 0.5753
Summary

This gene encodes a mitochondrial chaperone protein that is member of the heat shock protein 90 (HSP90) family. The encoded protein has ATPase activity and interacts with tumor necrosis factor type I. This protein may function in regulating cellular stress responses. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.