Basic Information

Symbol
TREH
RNA class
mRNA
Alias
Trehalase TREA Alpha,Alpha-Trehalose Glucohydrolase TRE Trehalase (Brush-Border Membrane Glycoprotein) Alpha,Alpha-Trehalase EC 3.2.1.28 MGC129621 TREHD
Location (GRCh38)
11:118657316-118679690
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007180.3
Sequence length
2748.0 nt
GC content
0.5739

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1092.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1141.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 766.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001301065.2 NCBI
AUUCAGUCACAGUCACAGCCACCAUGCCAGGGAGGACCUGGGAGCUGUG… 2655 nt 0.5744
NM_007180.3 NCBI
AUUCAGUCACAGUCACAGCCACCAUGCCAGGGAGGACCUGGGAGCUGUG… 2748 nt 0.5739
Summary

This gene encodes an enzyme that hydrolyses trehalose, a disaccharide formed from two glucose molecules found mainly in fungi, plants, and insects. A partial duplication of this gene is located adjacent to this locus on chromosome 11. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

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