Basic Information

Symbol
TRIM14
RNA class
mRNA
Alias
Tripartite Motif Containing 14 KIAA0129 Tripartite Motif-Containing Protein 14 Tripartite Motif Protein TRIM14 Tripartite Motif-Containing 14
Location (GRCh38)
9:98068968-98119399
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014788.4
Sequence length
4480.0 nt
GC content
0.5321

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1589.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1665.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1252.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014788.4 NCBI
CUGUGUCCCGGGGAGCCGGAGGAGGUGGAGAUGAAUGGCGGGCGCGGCG… 4480 nt 0.5321
NM_033219.3 NCBI
CUGUGUCCCGGGGAGCCGGAGGAGGUGGAGAUGAAUGGCGGGCGCGGCG… 1505 nt 0.6120
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to cytoplasmic bodies and its function has not been determined. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

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