Basic Information

Symbol
TRIM27
RNA class
mRNA
Alias
Tripartite Motif Containing 27 RNF76 Ret Finger Protein RFP Tripartite Motif-Containing Protein 27 Zinc Finger Protein RFP RING Finger Protein 76 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase TRIM27 Tripartite Motif Protein TRIM27 Tripartite Motif-Containing 27 RFP Transforming Protein EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
6:28903002-28923988
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006510.5
Sequence length
2963.0 nt
GC content
0.5451

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1136.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1189.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 672.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006510.5 NCBI
ACGCUGCCGCCGGCAUCCGCUCGGACGCGGCCACGUUGUCUUGCGCGCU… 2963 nt 0.5451
Summary

This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This protein localizes to the nuclear matrix. It interacts with the enhancer of polycomb protein and represses gene transcription. It is also thought to be involved in the differentiation of male germ cells. Fusion of the N-terminus of this protein with the truncated C-terminus of the RET gene product has been shown to result in production of the ret transforming protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.