Basic Information

Symbol
TRIM37
RNA class
mRNA
Alias
Tripartite Motif Containing 37 POB1 E3 Ubiquitin-Protein Ligase TRIM37 KIAA0898 TEF3 MUL RING-Type E3 Ubiquitin Transferase TRIM37 RING-B-Box-Coiled-Coil Protein Mulibrey Nanism Protein Tripartite Motif-Containing Protein 37 Tripartite Motif-Containing 37 Mulibrey Nanism EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
17:58982638-59106921
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015294.6
Sequence length
4489.0 nt
GC content
0.4415

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1336.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1422.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1502.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005207.5 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 3583 nt 0.4641
NM_001320987.3 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4387 nt 0.4413
NM_001320988.3 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4372 nt 0.4394
NM_001320989.3 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 3466 nt 0.4622
NM_001320990.3 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4448 nt 0.4424
NM_001353082.2 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4414 nt 0.4415
NM_001353083.2 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4506 nt 0.4405
NM_001353084.2 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4516 nt 0.4418
NM_001353085.2 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4299 nt 0.4422
NM_001353086.2 NCBI
GCAGCUUCUCUCGCCGCCGCGCCCCCAGCUGCUCUGGUUACGGUUGGUG… 4438 nt 0.4428
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family, whose members are involved in diverse cellular functions such as developmental patterning and oncogenesis. The TRIM motif includes zinc-binding domains, a RING finger region, a B-box motif and a coiled-coil domain. The RING finger and B-box domains chelate zinc and might be involved in protein-protein and/or protein-nucleic acid interactions. Mutations in this gene are associated with mulibrey (muscle-liver-brain-eye) nanism, an autosomal recessive disorder that involves several tissues of mesodermal origin. TRIM37 localizes in peroxisomal membranes, and has been implicated in human peroxisomal biogenesis disorders. [provided by RefSeq, Jul 2020]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.