Basic Information

Symbol
TRIM4
RNA class
mRNA
Alias
Tripartite Motif Containing 4 RNF87 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase TRIM4 E3 Ubiquitin-Protein Ligase TRIM4 Tripartite Motif Protein 4 RING Finger Protein 87 Tripartite Motif-Containing Protein 4 Tripartite Motif Protein TRIM4 Tripartite Motif-Containing 4 EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
7:99876958-99919601
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033091.3
Sequence length
3314.0 nt
GC content
0.4662

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1044.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1110.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1102.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_033017.4 NCBI
GCGUUGUACCCUUUUACGUGAGGCGGUGACGGCGGUUCGGAAGUCGUCU… 3392 nt 0.4652
NM_033091.3 NCBI
GCGUUGUACCCUUUUACGUGAGGCGGUGACGGCGGUUCGGAAGUCGUCU… 3314 nt 0.4662
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to cytoplasmic bodies. Its function has not been identified. Alternatively spliced transcript variants that encode different isoforms have been described.[provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.