Basic Information

Symbol
TRIM60
RNA class
mRNA
Alias
Tripartite Motif Containing 60 RNF129 RNF33 Tripartite Motif-Containing Protein 60 Ring Finger Protein 129 FLJ35882 Tripartite Motif-Containing 60 RING Finger Protein 129 Ring Finger Protein 33 RING Finger Protein 33
Location (GRCh38)
4:165016458-165041749
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152620.3
Sequence length
1847.0 nt
GC content
0.4061

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-492.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -528.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 482.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001258025.2 NCBI
AAAACUCGAAAACCAAGGCGCCCAGGGUUGUGUGAGGGUUUCCGCUCUG… 2021 nt 0.4171
NM_152620.3 NCBI
AAAACUCGAAAACCAAGGCGCCCAGGGUUGUGUGAGGGUUUCCGCUCUG… 1847 nt 0.4061
Summary

The protein encoded by this gene contains a RING finger domain, a motif present in a variety of functionally distinct proteins and known to be involved in protein-protein and protein-DNA interactions. Pseudogenes of this gene are located on more than six chromosomes including chromosome 4. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jan 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.