Basic Information

Symbol
BIRC6
RNA class
mRNA
Alias
Baculoviral IAP Repeat Containing 6 BRUCE Dual E2 Ubiquitin-Conjugating Enzyme/E3 Ubiquitin-Protein Ligase BIRC6 BIR Repeat-Containing Ubiquitin-Conjugating Enzyme Baculoviral IAP Repeat-Containing Protein 6 Apollon Ubiquitin-Conjugating BIR-Domain Enzyme Apollon Ubiquitin-Conjugating BIR Domain Enzyme Apollon RING-Type E3 Ubiquitin Transferase BIRC6 Baculoviral IAP Repeat-Containing 6 EC 2.3.2.24 KIAA1289 APOLLON
Location (GRCh38)
2:32357023-32619571
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016252.4
Sequence length
15687.0 nt
GC content
0.4310

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4534.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4842.36 kcal/mol
Frequency: 1.88944e-217
Diversity: 4335.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001378125.1 NCBI
AGUGUGAUUGUGCUGAGCGCAGGCCGGAAGAUGGCGGCUGCGGCUGCGG… 15575 nt 0.4277
NM_016252.4 NCBI
CUCCCUCCCUGCUUCUCCCCCUCUCCCGUCAGCCUCCCUCCGAGUUUGG… 15687 nt 0.4310
Summary

This gene encodes a protein with a BIR (baculoviral inhibition of apoptosis protein repeat) domain and a UBCc (ubiquitin-conjugating enzyme E2, catalytic) domain. This protein inhibits apoptosis by facilitating the degradation of apoptotic proteins by ubiquitination. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for BIRC6 Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the BIRC6 gene can generate hundreds of circRNA isoforms, whose expression changes (rCLR) during cervical tumorigenesis can differ [Li et al. DOI:10.1093/bib/bby006].