Basic Information

Symbol
TRIQK
RNA class
mRNA
Alias
Triple QxxK/R Motif Containing PRO0845 C8orf83 Triple Repetitive-Sequence Of QXXK/R Protein Homolog Triple QxxK/R Motif-Containing Protein DKFZp779L1068 LOC286144 Chromosome 8 Open Reading Frame 83 Protein TRIQK UPF0599
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001171797.2
Sequence length
3667.0 nt
GC content
0.3447

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-847 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -920.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 961.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....................(((.(((((((((.(.(((......))))))))))))))))...((((((((...((((.............))))(((((..((((..(((((((..((((....((((((.((((((((((((((.(((((((((...))))))))))))).........(((((.......)))))...((((((((..((((((.......))))))..(((((((((((.((((.......)))).(((((((((((.(((((...((((..((..((((((..((((((.((((((((.(((.((((.(.......((((((..........((((.((((((.(((...(((((((..((((((((((....(((......(((..(((((((((((((((........((((((..((((((.(((((.(((...((((((..((((.......)))).....))).((((...)))).)))...)))..))))).))))))))))))....(((((((....(((((((...((......)).(((((((.(.(((((((((.(((........))).((((((((((((((((((((((.((((((...((((((......(((((....))))).(((((((((...((((...(((((.(((.......))).))))).....))))...))).))))))..((.((.((((((((.((.((((..(((((((((......)))).)))))..(((((........)))))....((..(((((((((.........)))).........((((((((((......)))))....)))))..)))))..))......(((((((((((.....(((((.(((((((((((((...(((((((..(((((((...........))))))).........)))))))...))).((((.((.(((((((((((.....((.((.(((.......................)))))))))))))))))).))))))))).)))))))(((.....)))((((((...((((.((...((.(((((......(((((.(((.(((((((....)))))).).)))...)))))..(((((((((((.((((...)))).((((((.(((((((...((((.............((((.....(((((((((.....((.(((.(((........((((......))))...........((((((((..(((((((...)))))))))))))))..)))))).)).....)))))))))))))))))..))))))).)))))).....))))))))))).....(((.(((((...((((((..(((.((((.............((((.......((((((((((......)))).....(((((((...)))))))...........(((((.(((((.(((.(((((....))))).)))...))))).))))).......))))))..(((((((..........))))))).....(((((.(((((.((((((((((((.(((.(((((.(((((((((((...(((.(((.............))).)))...............))))))))))))))))..))).))))..............))))))))..))))).)))))..)))).....)))).))).))))))))))))))...))))).))...)).))))...))))))...)))))......)))))))))))..(((((((.....)))))))......)))).)).)))))))).)).))(((.((.....)))))((((((((.(((((((((....(((((((...))))....(((((((((.......((((...((((((.....((((...(((((.((.((((.((((((((((...(((.....))).)).))))))))))))..))((((((((((.........(((.........))).........))))))))))...((.(((((...(((((((.............)))))))...))))).))..))))))))))))))).))))....((((........)))).((((...(((....)))..))))...))))))))).((..((((.((((..((.(((((((((((((..((((..(((((((.(((..(...(((((((((.......)))))))))..)..))).)))))))...)))).))))))))))))).))..)))).))))..))..)))....)))))..((((......))))...........)))).))))))))))))))...)))))).......))))).......))).))))))))..))))))..................(((((.(((.((((.....))))..))).)))))...............((((.......))))....))))))))).).)))))))..........(((..((((.((((.((((((((((((.................)))))).)))))).))))..))))..)))....(((((..........)))))((((...((((((........))))))...)))).)))))))))))))).(((.(((((.((....))))))).)))..........))))((((((.......................))))))......)))))..))))))..)))......)))..))))))).)))...)))))))......(((((...)))))..)))...)))))).))))))))))).)))))))....(((..(((((...))))).)))((((....(((((((.(((((..((((........)))).))))))))))))))))...(((((((((..((.((((((((((((((..........)))...)))))))).............(((......)))..((((.....))))..)))))..)))))))))......(((........)))..)))))))).))))))((((.((((((....)))))).)))).....(((((((((((.......((((.((........)).))))........))...)))))))))...))))))))..))))....))).))))))))))))).)))).))).)))).((((...((((.(((((((.....(((((.....)))))...))))))).))))....))))....((((((..((((((((((.........))))))))))..))))))..))))))))..(((((((((((((((((.(((((............))))).))))....(((..(((..........)))..))).)))))))).))))).)))))))))).))))))....))))..((((((....)))))).(((((((((((......)))).))))))).))))))).))))..))))).......))))))))(((((..(((..(((((..((((....)))).)))))..)))..)))))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
...................,.(((.(((((((((.(.(((......)))))))))))))))).}}((((((((..,((((.............))))(((((..((((..{((((((..{(((..,.((((((.((((((((({,{{{.(((((((((...)))))))))}}}}.........|||{|,|,,...})}},...((((((((..((((((.,....,))))))..(((((((((((.{(((......,}}}|.(((((((((({{(((((...{(((..{,..(({{((,{{({((({{{{{{{{,,|||,|{{{,,....,,,||||||..........,((((((({((,(((...{{{{{{{.,|||||{{|||,,,.{{,......(((..{(((((((((({{{{........((((((..((((((.(((((.(((.,.(((((.,,{,,,.{{{{{.},,,......,)}|||...,}})).))).,.)))..))))).)))))))))))),,,,(({{{{(,,,,((((((((..{(,,,,,,}}.{{{{{{{.{,||||||{{{.{||,,...,..}}}.((((({((((((((((((((((.{(((((...((((((......{((((....))))}.(((((((((...((((...(((((.,((.......))}.))))).....))))...))).))))))..((.,{.((((((((.((.((((..{{(((((((.,....|}}|,||}}}..((({{........)))}}..,,{{..||,{|||,,.........||||{{((((.({.(((,(((((......)))))..}}),)))}}))),,..))},....{((((((((((.....(((((.(((((((((((({...{((((((..(((((((...........))))))).........))))))}...}},.,,,,.((.((((((((((,....{((.{{.(((.......................)))})))))))))))))).)),,}}))).))))))),|{.....},|((((((...((((.((...((.(((((......(((((.(((.,((((((....)))))).}.)))...)))))..(((((((((((.((((...)))).((((((.(((((((...((((.............((((.....(((((((((....,({.(((.(((.,{{,...((({...,..)))).,..,......((((((((..(((((((...)))))))))))))))..}))))}.)),.},.)))))))))))))))))..))))))).)))))).....))))))))))).....(({,(((((...((((((..(((.((((.............{,,,,{,....{{|{{{((((......)))},....(((((((...))))))}......,,{,.(((((.(((((.((({(((({....})))).,))},.))))).)))))...,.,,,}}}}}..{{(((((....,,,,..)}))))},,,,.(((((.(((((.((((((((((((.(((.((({((((((((((((({,.(((.(((.,...........))).))).,,............))))))))))))))))..))).))))..............))))))))..))))).)))))..}})),.,,.)))).))).))))))))))))))...))))).))...)).))))...))))))}..}))))......)))))))))))..(((((((.....)))))))......)))).)).)))))))).,,.)).,{.{{.....}}))}((((((((.(((((((((,,,,((((,{,....{{{{,(((((((.{{((,,{{,,,.,{|,|||||{{{....((((,....|)))}.,,|,|,{(((((((((..,(({...,}))}.}).)))))))}.,,,....{(((((({,,.,,,.}}}|(((,,,..,,{{||,.........,,,|||||||,,,((.,{{(({..,,,,,,|}}|||},,.....}}}|||,.{{|||||.},{{||||,|{{..,|}|||||},,,..((((........)))).((((...(((....|}}..|}}}........||,..||,.||{(,(({{.,||,{{{{||||{||||,.||{|,,,{|||||,{{{,,|,,,|{|||{{{{.,,,,,,,}}))))))..},,))),)}}}|||....))),||||||}}})))),)),,)))),}))),.},...}}},,.)))))..((((......))))...........)))).))))))))))))))...)))))}.......)))),......,))).))))))))..})))))||}||...,,...}|}}}(((((.{((,((({....,))))..))).)))))...,|,,.,....,.{(((,..,,,,}}}}....}})))}))}.},)))))})..,,{{{{,,(((..{{{{.((((.((((({{{{{((,,...............}))))).)))))).)))}..}}}),}))),,.,{{{{{..........}}}}|{{{{...((((((........))))))...}}}}}}}}})))})))})).,{{,(((({|{{....}}))))).}}},,,,,,|...}}}}{{{{{{..,.....,,,,...}},,....)))}}),..,,,))))}.}})))))..))),.....,,,..))))))).}}}...))))}}}.}|...(((({...}))))..,}}...}}}}}}.||||}}}}}}|.,,,||||,..,||,..{((({...})))|{{,(((((,...{(((({(((((((..((((........)))).))))))))))))))))}.,}},,,{{({{{{..{{|||||||{,(((....}}}.,.,,}}}})))),,..,,,,{{|,,,,,,{|{|..,,,}}},,{(((.....}})),,,|}|||,,|{{{||{{{{{...(((,......||}}..}}}))))))}}})|||(((.((((((....)))))).))))},....,,|,,||,.....,,|.{(((.((........)).))))}},,}}}))}),}))))))))}...))))))}}|,)))}....))).})))))))))))).))))}}})},))}.,,,{...((((.(((((((.,...(((((.....)))))...))))))).})}|,,,,||||....{{{{{{..((((((((((.........))))))))))..)))))),,))))))))..(((((((((((((((((.(((((............))))).)))}|,..{((..(({..........})}..))},))))))))}})))).}))))))))).))))))....)))}..((((((....)))))).{((((((((((......)))))))))))}.))))))}.))))..)))))....}..))))))))(((((..(((..(((((..{{{,....}}}}.)))))..)))..)))))..................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
CUCUUUUCCGCCUCACCCUUUGGGAGUAGGGGUGUGCGGCUGGCUUGUC… 3664 nt 0.3444
CUCUUUUCCGCCUCACCCUUUGGGAGUAGGGGUGUGCGGCUGGCUUGUC… 3822 nt 0.3467
CUCUUUUCCGCCUCACCCUUUGGGAGUAGGGGUGUGCGGCUGGCUUGUC… 3667 nt 0.3447
CUCUUUUCCGCCUCACCCUUUGGGAGUAGGGGUGUGCGGCUGGCUUGUC… 3663 nt 0.3443
CUCUUUUCCGCCUCACCCUUUGGGAGUAGGGGUGUGCGGCUGGCUUGUC… 3508 nt 0.3421
CUCUUUUCCGCCUCACCCUUUGGGAGUAGGGGUGUGCGGCUGGCUUGUC… 3866 nt 0.3606
GUGCUGACCGAUUACUCGCGGUCGCUUACUUGUCAGUGCAGCUCUCUGG… 3614 nt 0.3403
Summary

Predicted to be located in endoplasmic reticulum membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.