Basic Information

Symbol
BIVM-ERCC5
RNA class
mRNA
Alias
BIVM-ERCC5 Readthrough ERCC5-202 DNA Excision Repair Protein ERCC-5 BIVM-ERCC5 Protein
Location (GRCh38)
13:102799110-102875994
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HGNC NCBI Ensembl GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001204425.2
Sequence length
5137.0 nt
GC content
0.4327

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1423.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1524.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1395.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204425.2 NCBI
GAGCUCAUUUUGCAGCUCUCAAGCUUUUAUAGCAUGCUGUAAACAAUUG… 5137 nt 0.4327
Summary

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring BIVM (basic, immunoglobulin-like variable motif containing) and ERCC5 (excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5) genes on chromosome 13. The read-through transcript encodes a fusion protein that shares sequence identity with the products of each individual gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the BIVM-ERCC5 mRNA was significantly downregulated in circulating T cells during the injury stage following major trauma compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].