Basic Information

Symbol
TSGA10IP
RNA class
mRNA
Alias
Testis Specific 10 Interacting Protein FAM161C Testis-Specific Protein 10-Interacting Protein Tsga10-Interacting Protein FLJ32880
Location (GRCh38)
11:65945480-65959966
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152762.3
Sequence length
1893.0 nt
GC content
0.6233

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-830.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -859.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 568.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((...(((((((...((.((((((((..(((((........(((((.....))))).((.((((.......(((((....(((.((((((((((((((((((((.(((...((((...(((((((((.(((.(((((....)))))((((((((((((.....(((((((.((((((....((((.(((((((..((...)).............((((((((...)))).)))).)))))))(((.(..(((((((((....(((((((((.(((((.........((((((((((((((...((((((((.............))).)))))((((.((((((..(((((....((.((((...((.((((((.......))))))..))......)))).))...........)))))...))))))))))..............(..(((((((....((((((((....)))).(((((((((((((....(((((((((..(((((((.....))))))).(((((......)))))...(((((.....)))))..(((((((...((.(((((.((..((((((....((((((((((...(((((.(((((......)))))........((((..((((((((.((((...))))(((.(((.....))).)))......((....)).......((((((((((.(((((((.(((((((...(((((.........)))))....))))....))))))))).).)).)))))))))))))))).)))).(((((....(((((.(((....((((..(((((((....)).)))))))))..))).)))))....)))))...(((((((((((((...)))))))))))))))))).........))))))).))).....))).)))......)).))))).)).))).)))).((((....))))..)))))))))(((.....))).....(((((...(((((....))))))))))...)))))))))))))..)))))))))))..).)))))))))).).))).....((((((..(....)..)))))).......)))))..)))))))))((((((((((..((.((...((((((....)))))).........)).)).))))))))))......)))))))))..))))((((((...((((((((..((.......))..))).))))).....))))))(((((((........)))))))))))....)))))).)))))))((((..........))))((((((.((.((((((((((((((((...((.((..(.......)..)).))..))))))....)))))))))))).......((.(((...))))).))))))..))))))))))))(((.(.......))))((((((((((.(((((....))))).))..(((((((.((..((((.(((.((.((....((((((((((........)))))))).))...((((((......))))))..))))))))))).)).))))))).((((.....))))....)))))))))))))).))))))...))))...((((((...)))))).))))))).)))))))))..)))).....))).)))...))))).....)))).))....)))))..)))))))).))...(((..(((((((......((((....))))......)))))))..)))........((((...((((.(((...((........)).))).))))..))))))))))).)))..............)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((.((((((((({(((.(((......(((((.(((.((((.(((.....(((((.....))))).(((((((...........(((((((((((((((.(.(((((((((((.((((((,,{{({{{(((((((({(.{{(((((....))))),,.,,)).))))))).))))}.}),}}|{((((((((((.(((((((..,,...}}..,.}},,.....((((((({...})))},))).))))))),{{{{{.|{.|||..||,}}|||.((((((((((((.((..((.....))..)}...,.((((((((((...(((((.(((((....(((((((({(({((({.((((({,({((.((((...((.((((((.......))))))..))......)))).)).,,........|},}}...||||||{,(((,.{.,{(.({(({..(((.((((((((((..((((....))))..))}}))}}.}})))..))}))))),..|||,|..}}}.}))))),|.{||||,,,,,.}}}}}...(((((.....)))))..}))),,,..}}}),))).....))))))))...((({{{({({{.(((.((((((.(((.(({(((.,..},}...((|{..{{{,...},))}}..}))))).)))))).)))}.)))).))}...)))))))))).)))))))))),)))))))))))).}))})})))))))}.))))))))))).))))))))(((((.(((({{..((((((((,,({,{{{||{.|||}|||,,|,......|{|||.|||....,(((,.,{{{{||,,..}}))))))))))..))),))))},.))))))))).(((((((((((((...))))))))))))))))))))}..{{{....}|}|{....,,}}}.)))))))))))))).))).)))))....))).)))}.((((,{......))))(((((((((((.,.,...((({,...,(((((..,.({..{||||,..({({((((,{({((.,((({...|||.,((({((((((((((((((.....((((({..(....)..))))))......{((((.....((((...((((((((((..((.({.,.((((((....)))))).}.......)).)}.))))))))))....))))))))),)))).,,}}).))))))}|)))){||({((({.......)))}..))))).,||||,,((((((((........)))))))},|,..{||||||..|||{{{(((((..........)}}}|({.{{,|,.,((((((((,,((({{,..{|}||.}|}}}}}}.,,.||{||{{{..((((((.,((((.(((((.((.{{..((.((((.((((((((........)))))(((..((....))..))}(((((.(((((((((((((.((((((((((....)))))....)))...)).))))).||....((((((((((........)))))))).))...((((((......))))))...)))))))))))((((....))))))).)))).))...}})),))))).)))),.))))))|||{|||{{{{{((({...}))))}}}},}}},..}}))))).}))})))}}}}.}}},)}...))))},,}}.}})}.({((((({,,..,{|,.|,.....}.)||,..|||||||}.....|,,|}}}}))))}}}}}}))}})),..},),},,})).}})))))))))))...(((((............)))))))))))).)).))|.,,,,..,..........,}|{|....}})...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001395491.1 NCBI
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACU… 1932 nt 0.6232
NM_001395492.1 NCBI
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACU… 1800 nt 0.6272
NM_001395493.1 NCBI
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACU… 1756 nt 0.6270
NM_001395494.1 NCBI
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACU… 1032 nt 0.6231
NM_001395495.1 NCBI
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACU… 1174 nt 0.6175
NM_152762.3 NCBI
UUGGGCCUGGGUCUCUGCGCUAAAUGACUCCUGGGCAUCCUGCUGAACU… 1893 nt 0.6233
Summary

Predicted to be involved in cilium organization. Predicted to be located in cytoskeleton. Predicted to be active in photoreceptor connecting cilium. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.