Basic Information

Symbol
TSPAN2
RNA class
mRNA
Alias
Tetraspanin 2 TSPAN-2 TSN2 Tetraspan NET-3 Tetraspanin-2 FLJ12082 New EST Tetraspan 3 Tetraspan TM4SF Tetraspan 2 Tspan-2 NET3
Location (GRCh38)
1:115048011-115089503
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005725.6
Sequence length
3216.0 nt
GC content
0.3678

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-821.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -884.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 968.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308315.2 NCBI
GCCGGAGCCUGCCGCUCCCCGCGCUCGUAGCGCGGGCCUGGGGACUGGG… 3141 nt 0.3664
NM_001308316.2 NCBI
GCCGGAGCCUGCCGCUCCCCGCGCUCGUAGCGCGGGCCUGGGGACUGGG… 3132 nt 0.3665
NM_005725.6 NCBI
GCCGGAGCCUGCCGCUCCCCGCGCUCGUAGCGCGGGCCUGGGGACUGGG… 3216 nt 0.3678
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Apr 2015]

Forensic Context

A study in humans and mice demonstrated that TSPAN2 is a component of a migrasome-related gene signature with robust diagnostic performance for acute myocardial infarction, achieving an AUC of 0.955 in a training cohort [Zhu et al. DOI:10.3390/biomedicines12071626]. In humans with erectile dysfunction, single-cell RNA sequencing revealed its expression in endothelial subclusters within cavernous tissue [Fang et al. DOI:10.3389/fendo.2022.874915]. A study in mice demonstrated that dietary methylmercury exposure in male BALB/c mice significantly altered hippocampal protein and RNA expression, with the TSPAN2 being downregulated at both the protein and RNA levels following high-dose exposure, indicating its role in oligodendrocyte differentiation is affected by neurotoxic insult [Mellingen et al. DOI:10.1093/Mtomcs/Mfab022].