Basic Information
Symbol
TSPAN7
RNA class
mRNA
Alias
Tetraspanin 7
DXS1692E
TALLA-1
A15
Transmembrane 4 Superfamily Member 2
TM4SF2
CD231
MXS1
Membrane Component Chromosome X Surface Marker 1
Cell Surface Glycoprotein A15
Tetraspanin-7
CD231 Antigen
Tspan-7
MRX58
T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Associated Antigen 1
T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia-Associated Antigen 1
Membrane Component, X Chromosome, Surface Marker 1
Mental Retardation, X-Linked 58
Transmembrane 4 Superfamily 2b
Transmembrane Protein A15
Tetraspanin Protein
TM4SF2b
CCG-B7
XLID58
Location (GRCh38)
X:38561498-38689249
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
MANE select
Transcript ID
NM_004615.4
Sequence length
1742.0 nt
GC content
0.4673
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-509.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-541.16 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
447.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUAGUAUGGCAUCGAGGAGAAUGGAGACCAAACCUGUGAUAACCUGUCU… | 1742 nt | 0.4673 |
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is a cell surface glycoprotein and may have a role in the control of neurite outgrowth. It is known to complex with integrins. This gene is associated with X-linked cognitive disability and neuropsychiatric diseases such as Huntington's chorea, fragile X syndrome and myotonic dystrophy. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans and mice demonstrated that the TSPAN7 is a migrasome-related gene and a component of a diagnostic signature for acute myocardial infarction (AMI), where it was downregulated in AMI cases in the training cohort [Zhu et al. DOI:10.3390/biomedicines12071626].