Basic Information

Symbol
TTBK2
RNA class
mRNA
Alias
Tau Tubulin Kinase 2 KIAA0847 Tau-Tubulin Kinase 2 SCA11 Spinocerebellar Ataxia 11 EC 2.7.11.1 EC 2.7.11 TTBK
Location (GRCh38)
15:42738730-42920850
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_173500.4
Sequence length
11208.0 nt
GC content
0.4173

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3219 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3439.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2678.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_173500.4 NCBI
GCAGUAGUCGCCGCAGCGGCGAUGGGAGCGGUGGGGACGAGGCGGCGGC… 11208 nt 0.4173
Summary

This gene encodes a serine-threonine kinase that putatively phosphorylates tau and tubulin proteins. Mutations in this gene cause spinocerebellar ataxia type 11 (SCA11); a neurodegenerative disease characterized by progressive ataxia and atrophy of the cerebellum and brainstem. [provided by RefSeq, Aug 2009]

Forensic Context

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