Basic Information

Symbol
TTC17
RNA class
mRNA
Alias
Tetratricopeptide Repeat Domain 17 Tetratricopeptide Repeat Protein 17 TPR Repeat Protein 17 FLJ10890
Location (GRCh38)
11:43358920-43494933
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018259.6
Sequence length
4488.0 nt
GC content
0.4519

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1304.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1396.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1097.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001307943.2 NCBI
GCUUCCGGUGUGAGCGGCCCGGCCGGGGGGGCAAGAUGGCGGCGGCAGU… 3459 nt 0.4496
NM_001376525.1 NCBI
GCUUCCGGUGUGAGCGGCCCGGCCGGGGGGGCAAGAUGGCGGCGGCAGU… 4659 nt 0.4520
NM_001376526.1 NCBI
GCUUCCGGUGUGAGCGGCCCGGCCGGGGGGGCAAGAUGGCGGCGGCAGU… 4398 nt 0.4534
NM_001376527.1 NCBI
GCUUCCGGUGUGAGCGGCCCGGCCGGGGGGGCAAGAUGGCGGCGGCAGU… 4074 nt 0.4534
NM_001376528.1 NCBI
GCUUCCGGUGUGAGCGGCCCGGCCGGGGGGGCAAGAUGGCGGCGGCAGU… 3990 nt 0.4534
NM_018259.6 NCBI
GCUUCCGGUGUGAGCGGCCCGGCCGGGGGGGCAAGAUGGCGGCGGCAGU… 4488 nt 0.4519
Summary

Involved in actin filament polymerization and cilium organization. Located in actin cytoskeleton; cytosol; and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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