Basic Information

Symbol
TTC3
RNA class
mRNA
Alias
Tetratricopeptide Repeat Domain 3 RNF105 DCRR1 TPRDIII TPRD RING-Type E3 Ubiquitin Transferase TTC3 Tetratricopeptide Repeat Protein 3 E3 Ubiquitin-Protein Ligase TTC3 RING Finger Protein 105 TPR Repeat Protein 3 TPR Repeat Protein D TPRDII TPRDI Protein DCRR1 EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
21:37073226-37203112
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001330683.2
Sequence length
7842.0 nt
GC content
0.4167

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2162.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2311.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2507.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001001894.3 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 7733 nt 0.4124
NM_001320703.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 7906 nt 0.4164
NM_001320704.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 7896 nt 0.4162
NM_001330681.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 6877 nt 0.4189
NM_001330682.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 6986 nt 0.4237
NM_001330683.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 7842 nt 0.4167
NM_001353936.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 6996 nt 0.4240
NM_001353937.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 7668 nt 0.4129
NM_001353938.2 NCBI
ACCCGCUCCCUCCCGCCGUCGGCUGACGUGGAGGGCCGGAGGUGGCGGC… 6921 nt 0.4244
NM_003316.4 NCBI
CCUAAAGAAAAGUAUUAAGUAAAUAGCAGUACAGAUGGCAAAUGGAUUG… 9018 nt 0.4054
Summary

Enables ubiquitin-protein transferase activity. Involved in protein K48-linked ubiquitination and ubiquitin-dependent protein catabolic process. Located in cytosol; nucleolus; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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