Basic Information

Symbol
BMF
RNA class
mRNA
Alias
Bcl2 Modifying Factor Bcl-2-Modifying Factor FLJ00065
Location (GRCh38)
15:40087889-40108928
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001003940.2
Sequence length
4692.0 nt
GC content
0.5473

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1821.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1900.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1467.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.(((...(((((...)))))...(((((.(((((((((((((....(((((..(((.(((((((((..(((((((.(...........).)))))...)).))))..((((((((((((..((((..(((((((.(((((((...(((....)))....)))))))))))).))(((((((((((........((((((((((....((((((((((......)))))))))).((.(((((..(((((.(((((((((((((((..........(((.......))).(((((((.(((..(((.....))).))).)))))))(((((.......(.((((......)))).).......)))))...))))))))))))).....)).)))))..))))))))))))))))).......))).((((......((((.((((((.(((((((..((((((.((((.(((((.(((((.((((...)))).))))).((((((((((((((...((.....))...)))))).....)).))))))..((((.(((..((((.((.(((((((((.((((((.......)))))).)))))).))).....((((((.((((.(((.((((((((...((((..((..((.(((((..(((((....((((((((((.((...((((((((((.......)).))).))))).....((((.(((((((((((......))).......)).))))))...))))..((((((((((((.....)))))...))))))))).))))))))))....)))))...))))).)))).))))....))))))))..))))).)).)).)))).(((((((.......((((..((.....))..))))......)))))))....(((((((.........))))))).))))))..........))).)))).)))))..))))...))))))((((.((((......)))).)))).)))))).).))))).).)))).....))))..))))))))((((((((((((((((....)))))))))))...)))))...((((.(((.((((((((((....((((..(((((.(((((((.....((((((((((((.......(((.(.((((((..((.(((...(((......)))....))).)))))))).).)))((((((.((((.((....))))))...)))....))).((((((((..(((((((((((.(((......))).)))..........((((((....))))))......(((.(((((.........))))).)))..(((((((...))))...)))..))))))))))).)))))..(((((............))))).)))))))))))).((((((.......(((........)))........((((((...((((((......(((...))).......))))))))))))..))))))(((((((((.((....((((....))))(((.(((.(((.....))).)))))).(((.....)))....(((((.(((((...)))))))))).)))))))))))((((......((((....)))).......))))))))))).))))).)))))))))...))))).)))))))(((((((.((((.(..((((((.(((....(((..(((((.(.(((((.(((((..(((((.(((((........))))))))))...(((((((((((.....(((((.....(((((((((.............)).).))))))..)))))((((((((((((.(((((((((((((.((.((((...)))).))............(((.(((((((..........((((((.(((............((((((((((((((.(((((((.(......))))))..)).)))........((((((..((((..(((((.(((((((((((((((((((......((((.....)))).(((.(((.....))).)))))).))))))(..(((((((.(((((..((........................((((((....))))))..........((((.(((.((......))..))))))).))...))))).)))))))..)...((((((....(((((......(((.....(..(((((((...))))))).)...))).....)))))..)))))).........)))))))))).(((((((...)))))))))))).........(((......)))((((((((........))))))))..))))..))))))..)))))))))))...(((((((((.......))).)))))).))).))))))..(((.((((((.(((((....))))).)).(((((((((.(......).)))))))))....(((((.(((((((....((((.......)))).....)))).))).)))))..(((((((((((.(((((...)))))........(((((((((.((((.........(((.(((....))).)))....))))))))))))).((((((((((((((((((((.((((.(((..((((.((((((((((.((...((((....((((..(((....)))))))...)))).)).)))))((((((((((....)))).))))))((((.....))))....((.....)).))))).))))....(((((....)))))((.((((.....)))).)).((........)).........(((((((((((.((((((.....(((((..((((((((.((....))))).)))))..........((.((((((.((((((((...))).))))).))).))).)))))))(.((((((((.((((..(((.((((........).))))))...((((..........)))))))).)))))))).).)))))).))))).))).)))..))).)))).)))).))))))).))))))))).((((((......)))))).))))))))))).....)))).)))))))))).)))((((((..................))))))))))))))))))).))))))..((((((......)))))))))))).)))))))))))..((((.(((.......)))))))........)))).).))))).).)))))....)))........))).))))))).)))).)))))))..........(((((((((..(((.((((..............)))).)))((((....))))..))))))))).....))))..))))))))))))((((...((((...(......)...))))....))))))))).)))..)).)))..)))).))))((((((((((.((((.(((((...(((((((((.((((.........)))))))))))))((..(((((...))))).))......(((((((((......((((((......))))))..))))))..))).....(((..(((((((((((.....(((((((..(((((..((((.((.......)).)))).))))))))))))(((((((((((............))))))..))))).)))))))))))..))).(((((((.......))))))))))))..)))).))))))))))..))))).)))))))).))))))(((.((((.(((.....(((((((((......(((((((.((((.....(((((((((((((.(.(((((((((((...((((((.....))))))..)))))).((((((((((((..(((..(((.((((((........))).))))))..))))))))))))))).((((.......)))).(((((..(((..((((.....))))..)))..))))).((((((((((((((((((......(((((.((.(...(((....)))....).)))))))...)))))))).....((.((((((..((((((....))))))...((((...(((.((((..((((....))))...)))).)))..))))(((((((((.((((((..((..((((((.....((((...(((((.((((((((.((((.((((((((..((((....((.....((((.((........)).))))...))))))..)...))).))))))))))))))))..)))))...))))...))))))..)))))))).))))))..)))......)))))))).)))))))))).(((......))))))))..).)))))...))))))))...))))....((((((.(((((((((....)))))))))..)))))).(((.(((((.....))))).)))......))))))).)))))))))...))))))).))).....((((((.((((((((......(((((((((....)))))))))...............(((.....)))...........)))))..))).))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,((({{..{{,(((((,,,,||||.(.((,,,||,||||}..}||((((((({.({{(..((.((((({(({(({(((.{{(((({.,,,{(((((((((.((((((({{,..{{,,.,,,,,.....,(((((((((,(((((((...(((....})}....))))))){{((((.,{{,{{((((((.,...,..((((((((({....((((((((((......)))))))))).((.(((((..(((((.(((((((((((((((..........{{{.....,,)},,(((((((.(((..(((.....))).))).))))))}(((((...,,..{.((((......)))).}.,}....)))))...)))))))))))))....,)).)))))..)))))))}))))))))).......)))))).,......||||}}}}}}}}}..||||||||,{{(((((..(((((({......,))))))))))).}}||||||||.}}}}}||{((((....,|{{...((((((.,{(((,,,{{{{{{{{{{{..{....||,||}|...{((((.((((((.,....,)))))).))))}{((((((((.((((((.((((.(((.((((((((...((((..((..{(.(((((..(((((....((((((((((.{(,..(((((((({{.......}}.))).))))),,.,.((((.(((((((({({,,,...,,,.,,,..,)).))))))...)))).,((((((({((({.....,,}},}},)))))))}}.))))))))))....)))))...))))).)))).))))....))))))))..))))).)).)).)))).{{{{.....,,,.))))))))}...,,,,.,,{{......,,}}..{(((.{(((((((.........))))))},).)))}{{{{{.{{{{..(((((,,,,|}}}}..}}}}.)))))|||,,,,{|,,,,,,,,}},.))}}})))))},|{||||,.,.,|||{.{{{,,,,.||||||{,{((((((((((((((((....)))))))))))...)))))}..((((.(((.(((((({{({,...((((..(((((.(((((((|.|||{{{{{{{((({,.......{((.(.((((((..{(.(((..,(({......})}....))).)})))))).).))}((((((.((((,({....))))))...)))....))),{|||||{|.,{|||{(({(((.(((......))).))),,,,......((((((...,}}}||}......(((.(((((,........}}}}|,|||..(((((((...))))...}))..,})))))}}}|,|||}}..((({(,{,,.,,,,{,,|||||{|}}}|}}})))}.,|||||,,},...{{(........})).{((({..((((((...((((((......(((...)))....,,.))))))))))))}))))))}|||||{(((.((..,.((((....))))((,{(((.(((.....))).)))))).(((.....)))....(((((.(((({...}))))))))).)))))))))}}{{((.{.,..({{{....)))),,,,.,.))})))))))).))))).))))}}}}}..,})))).)))))))||||||,,|,,|}|{|,||||,,({{....,(({{((,,..,||||}}}|||||,,|{{{|.(((((.,......)))))))))},,,|||{||,|,.......,||||}}}}.,,{|||||}}}}},.,}}.,}}}..,.})))))}.,,,||(((((.,..,,|}}|}||||}}||,..||.|{,,..})))).,,...........{(((.((((((.,{{....(((((((.{{{{{.{{{{.{{{.{{{|,{(({..,}|}},||,,||}}}}}.}}},,,)),.})))))).||,.(((((....))))).,}},,}))))).)))}....)))))))))....,))})})),......))))|,)).))))).))..))...)).)))))})}{..{(((.....}})}..|,,,..............,,{,{{(,..{{{||||,.,,{{,.{{((({.,{,.,|}}}}..||,{|||||||,{{..,{||,,{|||||||({{...((((((.,..(((((......(({.....{..(((((((...))))))).}...))).....)))))..))))))..}}}},,})),))))}})))}|{{((,,.|||}|((((((......))))))..,(((((((((((((((........))))))},((((((((..((((...(((((((((....(((((((((.......))).}))))).{{{{{|(({{{((.((((((,..,((((.({{{{{{{,,(((((((((((.(......).))))))))),,,.(((((.(((((((....((((.......)))).....)))).))).))))).}}},.,,,,,,,.{((((...)))))......)))))))))}}.,)))}}}}}}}.,|}}}||},}}})),..,,...{|||,,,,.,,))))((((((((((((((((((((.(((({(((((,((({({,,,||.||}||}}}||{{....({{{..,{{,.,.},,}}}}...))}},||{}(((,((((((((((....)))).))))))}||.,,},.|,|||||,,{{|.||||,|,|{(((((.({{,(((((...,}||}}((.((((.....)))).}).((........}),........{{{{{(((({{.{{{{{{.....|||{{,.(((((((||((....))))).)))))..........,{.{(((({.((((((((...))).))))).}}})))}.})}))||({((((((({.{{{|.,|||.||||}}....,,},}}}))).,}||{,.....||||,||..|}}}.}}}})))),},)))))),))))),)}}.}}}..}))})})),)))).)))))))}})))))))).((((((......))))))..,(((||...,..,...,,{{{{|,{{(((((,(((((((.{((((((({.......,,{||,}}||||||||||,,|,|))|||{(((((((......)))))))))||{{||||,,,,}}}}}||}|{(({...,,,.,}}|{{{{{{{{((.{{.{(.(((((.((.((({{{...,.{{((...{((({.(((({{{{{,{{(({(((({(({((({{,,((((({{((((({{.({(((,{{{(({{{{,{,||{|,||}{{{{{||,||||,.}|}})))}}..{|{|..{{{,{||,,||||..,|||..,}})),}}}),,}}).}},}}}}))},.,,,))))})))}}..,,))}},,))),))))))||||||||.||||}|{|||...(((((((((.((((.......,.))))))))))))),...(((({...})))).||.,,,{{(((((((((......((((((......))))))..)))))),{((,{..{{((({{(((((((((((.....(((((((..(((((..((((.({.......)).)))).))))))))))))((((((((((({..........,))))))..))))).))))))))))|,,....(((((({.......})))))),,,})},}|||{||},,,,,,,.})))))}})))))))),))}}.|||.,,.))),)))}}))))}|||}}|}}}},(((((((.(((((.(((((((.(((((...)))))...{(((((...((((((.....)))))).,)))))}....))))))).)))))..)))))))((((({..(((((((((....)))))).))).))))))..,|,,,||||}.||||,{||||}}|||}}||||,....)})),.))),,))))),)).)))))))|{(({{{{,.,.|,|((({,{(,||..(((....)))..,.},)))))))|,|)}}))))}....{{{,,,,}|||,((((((....)))))).},.}.},.})))..}}))}...))}},.))))))..)).))))).)}....}).))))))))))},,}}}},|,((((((((...)))))))).}))))))||{{...,||,,..}}})))}.}}.}}}},..||})}}|....,}}}))}),,))))))))).))))..)))))))).|.(((((.({.|..(((((((((..,,((({((,.((((((((((((......)))))(((((...(.(((((......((((((......))))))......))))).}.))))).{{(((.,,||...)))}),,(((((((((....)))))))))...)))))))}})))))},)))))))))..,.))...))))).............,|}}}}}}}|{{{||,,,)))))}}},}}}}}.,,|,,..||||{|||{....})))))))).)})),,.}}}}}..{{{.....))),,...,{{{,,,..,,.....,,,,,.....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001398502.1 NCBI
AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4797 nt 0.5464
NM_001398503.1 NCBI
AGUUGUACCAGUCUCAGGUUCAGAGCUGGCAGGAGCGGGAGGCUGUGGA… 4667 nt 0.5382
NM_001398504.1 NCBI
AGUUGUACCAGUCUCAGGUUCAGAGCUGGCAGGAGCGGGAGGCUGUGGA… 4719 nt 0.5382
NM_001398505.1 NCBI
AGUUGUACCAGUCUCAGGUUCAGAGCUGGCAGGAGCGGGAGGCUGUGGA… 4533 nt 0.5389
NM_001398506.1 NCBI
GGCUUUUGUUUUUGCUGCUGAGCCUGGAGCUCAGCUCAGACUGAGAUAA… 4664 nt 0.5371
NM_001398507.1 NCBI
GGCUUUUGUUUUUGCUGCUGAGCCUGGAGCUCAGCUCAGACUGAGAUAA… 4530 nt 0.5377
NM_001398508.1 NCBI
AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4502 nt 0.5462
NM_001398509.1 NCBI
AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4612 nt 0.5453
NM_001398510.1 NCBI
AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4403 nt 0.5428
NM_033503.4 NCBI
GGCUUUUGUUUUUGCUGCUGAGCCUGGAGCUCAGCUCAGACUGAGAUAA… 4728 nt 0.5349
Showing 11 to 20 of 20 entries
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the BCL2 protein family. BCL2 family members form hetero- or homodimers and act as anti- or pro-apoptotic regulators that are involved in a wide variety of cellular activities. This protein contains a single BCL2 homology domain 3 (BH3), and has been shown to bind BCL2 proteins and function as an apoptotic activator. This protein is found to be sequestered to myosin V motors by its association with dynein light chain 2, which may be important for sensing intracellular damage and triggering apoptosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A systematic review of studies in human, mouse, rat, and pig models found that the BMF mRNA was upregulated in skeletal muscle at 24 hours postmortem, though its association with the postmortem interval was not statistically significant [Cianci et al. DOI:10.3390/ijms25158185].