Basic Information

Symbol
TUBD1
RNA class
mRNA
Alias
Tubulin Delta 1 TUBD Tubulin Delta Chain Delta-Tubulin FLJ12709 Tubulin, Delta 1
Location (GRCh38)
17:59859426-59892945
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016261.4
Sequence length
2491.0 nt
GC content
0.4067

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-674.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -720.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 845.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001193609.2 NCBI
GCAUUGUCAGCUGGAGCGUUCGGUGGACAGUGAGCAUGCGUACCAUAUC… 2326 nt 0.4054
NM_001193610.2 NCBI
GCAUUGUCAGCUGGAGCGUUCGGUGGACAGUGAGCAUGCGUACCAUAUC… 2320 nt 0.4047
NM_001193611.2 NCBI
GCAUUGUCAGCUGGAGCGUUCGGUGGACAGUGAGCAUGCGUACCAUAUC… 2185 nt 0.4041
NM_001193612.2 NCBI
GCAUUGUCAGCUGGAGCGUUCGGUGGACAGUGAGCAUGCGUACCAUAUC… 2422 nt 0.4108
NM_001193613.2 NCBI
GCAUUGUCAGCUGGAGCGUUCGGUGGACAGUGAGCAUGCGUACCAUAUC… 1915 nt 0.4026
NM_016261.4 NCBI
GCAUUGUCAGCUGGAGCGUUCGGUGGACAGUGAGCAUGCGUACCAUAUC… 2491 nt 0.4067
Summary

Predicted to enable GTP binding activity. Predicted to be a structural constituent of cytoskeleton. Predicted to be involved in microtubule cytoskeleton organization; mitotic cell cycle; and positive regulation of smoothened signaling pathway. Located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.