Basic Information

Symbol
BMP1
RNA class
mRNA
Alias
Bone Morphogenetic Protein 1 BMP-1 PCOLC Procollagen C-Endopeptidase Mammalian Tolloid Protein Tolloid-Like EC 3.4.24.19 PCP Procollagen C-Proteinase 3 Procollagen C-Proteinase EC 3.4.24 OI13 PCP2 MTld TLD
Location (GRCh38)
8:22165140-22212326
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006129.5
Sequence length
3593.0 nt
GC content
0.6028

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1495.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1552.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 665.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199.4 NCBI
AGUGCGCCGCUUCCCUCGCCGCCGCCCCGCCAGCAUGCCCGGCGUGGCC… 2506 nt 0.6065
NM_006129.5 NCBI
AGUGCGCCGCUUCCCUCGCCGCCGCCCCGCCAGCAUGCCCGGCGUGGCC… 3593 nt 0.6028
Summary

This gene encodes a protein that is capable of inducing formation of cartilage in vivo. Although other bone morphogenetic proteins are members of the TGF-beta superfamily, this gene encodes a protein that is not closely related to other known growth factors. This gene is expressed as alternatively spliced variants that share an N-terminal protease domain but differ in their C-terminal region. [provided by RefSeq, Aug 2008]

Forensic Context

A study in humans and mice demonstrated that the BMP1 is a migrasome-related gene upregulated in acute myocardial infarction (AMI) cases and is a component of a diagnostic gene signature with robust predictive performance [Zhu et al. DOI:10.3390/biomedicines12071626]. A study in mice demonstrated that formalin-induced inflammatory pain significantly upregulated the BMP1 gene, which is involved in G protein-mediated cell signaling, as the most pronounced change in the primary somatosensory cortex one hour post-injury [Erdei et al. DOI:10.3390/ijms26083538].