Basic Information

Symbol
TXNDC16
RNA class
mRNA
Alias
Thioredoxin Domain Containing 16 KIAA1344 Thioredoxin Domain-Containing Protein 16 ERp90 ERP90
Location (GRCh38)
14:52429472-52553563
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020784.3
Sequence length
4557.0 nt
GC content
0.3781

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1164.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1255.3 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1166.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001160047.2 NCBI
GAGUCGGUGGCGGCUGCAGGCUGGGAGGGAGAAGUGCUACGCCUUUGCA… 4542 nt 0.3782
NM_020784.3 NCBI
GAGUCGGUGGCGGCUGCAGGCUGGGAGGGAGAAGUGCUACGCCUUUGCA… 4557 nt 0.3781
Summary

Located in endoplasmic reticulum lumen. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.