Basic Information

Symbol
TYK2
RNA class
mRNA
Alias
Tyrosine Kinase 2 JTK1 Non-Receptor Tyrosine-Protein Kinase TYK2 EC 2.7.10.2 EC 2.7.10 IMD35
Location (GRCh38)
19:10350528-10380608
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003331.5
Sequence length
4243.0 nt
GC content
0.6140

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1839.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1898.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1084.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001385207.1 NCBI
AAGCAGUAGCUACCCGCGGGAGCGGGGAGGGGUCCGGGUUCGAGCUUGU… 4225 nt 0.6137
NM_001406461.1 NCBI
AAGCAGUAGCUACCCGCGGGAGCGGGGAGGGGUCCGGGUUCGAGCUUGU… 4153 nt 0.6179
NM_003331.5 NCBI
AAGCAGUAGCUACCCGCGGGAGCGGGGAGGGGUCCGGGUUCGAGCUUGU… 4243 nt 0.6140
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

This gene encodes a member of the tyrosine kinase and, more specifically, the Janus kinases (JAKs) protein families. This protein associates with the cytoplasmic domain of type I and type II cytokine receptors and promulgate cytokine signals by phosphorylating receptor subunits. It is also a component of both the type I and type III interferon signaling pathways. As such, it may play a role in anti-viral immunity. A mutation in this gene has been associated with Immunodeficiency 35. [provided by RefSeq, Sep 2020] CIViC Summary for TYK2 Gene

Forensic Context

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