Basic Information

Symbol
BMP10
RNA class
mRNA
Alias
Bone Morphogenetic Protein 10 BMP-10
Location (GRCh38)
2:68860909-68871397
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014482.3
Sequence length
6036.0 nt
GC content
0.4211

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1788.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1897.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1493.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014482.3 NCBI
UAAACCUUCCUGGCUUGGCCUAGGAGCUCGAGCGGAGUCAUGGGCUCUC… 6036 nt 0.4211
Summary

This gene encodes a secreted ligand of the TGF-beta (transforming growth factor-beta) superfamily of proteins. Ligands of this family bind various TGF-beta receptors leading to recruitment and activation of SMAD family transcription factors that regulate gene expression. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protein, which binds to the activin receptor-like kinase 1 (ALK1) and plays important roles in cardiovascular development including cardiomyocyte proliferation and regulation of heart size, closure of the ductus arteriosus, angiogenesis and ventricular trabeculation. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BMP10 shares chromatin transition patterns with the novel long non-coding RNA Novlnc6 and its expression was down-regulated upon Novlnc6 knockdown in neonatal cardiomyocytes [Ounzain et al. DOI:10.1093/eurheartj/ehu180].