Basic Information

Symbol
UBA1
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Like Modifier Activating Enzyme 1 CFAP124 UBE1X POC20 A1S9T UBE1 Ubiquitin-Like Modifier-Activating Enzyme 1 Ubiquitin-Activating Enzyme E1 GXP1 Ubiquitin-Activating Enzyme E1 (A1S9T And BN75 Temperature Sensitivity Complementing) UBA1, Ubiquitin-Activating Enzyme E1 Homolog (Yeast) A1S9T And BN75 Temperature Sensitivity Complementing POC20 Centriolar Protein Homolog (Chlamydomonas) UBA1, Ubiquitin-Activating Enzyme E1 Homolog A Ubiquitin-Like Modifier Activating Enzyme 1 Testicular Secretory Protein Li 63 POC20 Centriolar Protein Homolog Protein A1S9 EC 6.2.1.45 AMCX1 SMAX2 UBA1A VEXAS A1S9 A1ST
Location (GRCh38)
X:47190713-47215173
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003334.4
Sequence length
3572.0 nt
GC content
0.5694

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1377.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1441.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 911.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003334.4 NCBI
AUCUUGUGUCGGCGGCUCGGCUGUAAGGAGGUGGCAGGGACAACCACAA… 3572 nt 0.5694
NM_153280.3 NCBI
AAACUCUGGCUUCUCUUGUACGACAGAGGUGGUUUGCUCUUCCGUUGCC… 3480 nt 0.5629
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the first step in ubiquitin conjugation to mark cellular proteins for degradation. This gene complements an X-linked mouse temperature-sensitive defect in DNA synthesis, and thus may function in DNA repair. It is part of a gene cluster on chromosome Xp11.23. Alternatively spliced transcript variants that encode the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in cynomolgus macaques demonstrated that methamphetamine administration significantly decreased hippocampal expression of the UBA1 mRNA, which regulates cellular protein homeostasis, in both acute and chronic treatment groups compared to controls [Choi et al. DOI:10.1016/j.taap.2018.05.031].