Basic Information

Symbol
UBA2
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Like Modifier Activating Enzyme 2 HRIHFB2115 SAE2 Anthracycline-Associated Resistance ARX Ubiquitin-Like 1-Activating Enzyme E1B SUMO1 Activating Enzyme Subunit 2 SUMO-Activating Enzyme Subunit 2 FLJ13058 UBA2, Ubiquitin-Activating Enzyme E1 Homolog (Yeast) UBA2, Ubiquitin-Activating Enzyme E1 Homolog Ubiquitin-Like Modifier Activating Enzyme 2 Ubiquitin-Like Modifier-Activating Enzyme 2 SUMO-1 Activating Enzyme Subunit 2 EC 2.3.2.- EC 6.3.2 UBLE1B ACCES ARX
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_005499.3
Sequence length
4005.0 nt
GC content
0.4380

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1451.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1527.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 643.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((.((((((((((((.(((((.((((((.(((((...(((((.((((....((.(((((....))))).))....)))).))))).))))).)))))).).)).)).)))))))))))).)).)))))))))((((................))))...((((.((...(((((((....(((......)))....))))))).)).))))...............((((((....))))))(((((((((..((((((((((((.(((..(((.((..(((....((((((.....))))))..)))..)).)))........((((((((((.((..........(((((((...)))).))).........))))))).)))))......((((.(((((((......((((((.....))))))...)))))))..))))((.(((.....))).))(((((((((.....(((((((((((.((...........((((.(((..(.(((((((((((.........(((((....((.....))....))))).....))))))))))).)..)))..)))).....((((.((....)))))))))))))))))))))))))))).(((((((.(((((((........)))))))((((((((.((.((((((........(((((...(((((((.(((..(((....))).((((((((...((((.((((((.......(.(((((((....))))))).).......((((((((...)))))))).......))))))..))))....))))).).)).))).)))))))...((((.....)))).((((((..(((....)))..))))))((((.(((((((..(((((...(((((((....((((....(((((((((.((((((((((((..(((......)))((((((..(((((((((........)))))).)))..))))))((((((((..........)))))))))))))))).(((((((.((((((.(((((((.((.(((.((..(((((((((.(((((((.((((((((...((((((((((((((........(.(((((((((((((.........))))))...((((((....))))))(((((((((((......)))))))))))..(((((.((((.((((....)))).)))).)))))((((.((((((((........)))...........((((((((.(((((.....)))................((((((......))))))....)).))))))))))))).))))..........))))))).)....)).)).)))))))))).((((.(((...((((..(((.((((......)))).)))...))))..((((((((.......))))))))))).)))).....)))))..))).)))))))..((((....))))....((((((.....))))))(((.(((((((((((((((((((((((((((...((((....))))..))))))).((((((..(((.(.(((.....(((((((((.((((((....(((((.((((((.(((.......))).).))))).)))))...))))))...))))...((((((.......))))))....((((((((((((((((((((.............)))))))((.(.(((((.......)))))).))..(((((..(((((........)))))...))))).......((((((....)))))).(((.((((...((((((.((((..((((((.((......))(((((((((.((.((((((((((.(((((...((.((((.....((..(........)..))...)))).))...))))))))))....(((......)))..........))))).)))))))))))((((((......)))))).((((.(((((((((((.((((((...........((((((......(((((((...((((.........)))).)))))))......))))))........(((((....)))))((((((.((......)).))))))...)))))))))))))).((((..(((((((((((....((.((((..(((((((..((..((....((((((...(((((....)))))))))))..))..))...))))))))))).)).....)))...))))))))..))))...............(((((((((........)))))))))..))).))))..))))).)..)))).))))))...((((.....(((.((((.((.(((((...))))))).)))).))).....))))....)))).)))(((.((((((((......)))))))).)))....)))))))))))))....)))))...)))).)))..))))))..)))))))).))))))..))))))..)))...((((.(((.(..((((.......))))..)))).)))).....((((((......)))..))).)))))))))..)).)))...)).))))))).((((((((...............))))))))......(((((((.......)))))))...((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((((.(((((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((......(((((((((((.((((.((((((..(((.(((((((((((((((((...(((((((.((((((.(((((((((((.(((.(((((((.(((((((((((((((((.((((((((((((((.((((((((((((..((((.((((..((.(((((((((((..(..((((((((..((((((((....((((.(......(((..(((.((((((.((((((((.(((((((((((((((((...............))))))))))))))))).(.(((.((((....)))).))).)..(((((....))))).....(((.(((((.((((......))))..))))).)))((((...........)))).))))))))..)))))).)))..)))....)))))....))))))))))))))))..).))))))))))).))..))))..)))).))))).))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).))))))).))).))))))))))).)))))).)))))))...))))))))))))))))).)))..)))))).)))).)))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))....(((((.(((......((((....(.(((((((.......))))))).)))))....))).))))).....((((((.((((((........)))))).))))))..(((....))))))))))))))))..)))).))))))..)))......)))).......)))...)))).)))))......)))))))..))))(((...(((((((((.(..(((((....)))))..).)))))))))....)))))))).......)))).)).))))))))))((.((((.(..(((((.((......)))))))..).)))).))....(((......))).)))))))....))).)).)))).))))))..)))))))))............................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((({(.((((((((((((.(((((.((((((.(((((...(((((.((((....((.(((((....))))).))....)))).))))).))))).)))))).).)).)).)))))))))))).)).)))))))))((((..............,.))))...((((.((...(((((((,,.,({{..,..}),,....))))))).)).)))).....,,,.,{,,..((((((....))))))(((((((((..((((((((((((,{({,,{,({{(.{((...}}|,||||.....}}}}}}..,.},,}}},},.,|.{|,.(((((((({{{((..,..{{,,.(((((({...}))),}))..,}},,,.)))))))}})))).,,...,(((.(((((((.{..,.((({{{.....}))))}.}.)))))))..)))|((.(((.....))).))|((((((((.....(((((((((({,((..........,(({(.(((..{.(((((((((((((.,.....{((({....((.{,..,,}},,)))))}.}}.})))))))))).}..))).,,))).....{(((.{{....)))))})))))))))))))))))))))}.(((((({.(((((((........)))))))((((((((.((.{{((((......,.(((((,,(((..(((.{{....}}.((.(((.(((.......((..(((((({{((((...,,((,{{{|....}}|||||{|,{.....((((((((...))))))))...,,,......,,,.......|||{{{,,....((((.(((..((((((((((((((..{.(((((((((((...,{{{.((((((....((((((((...,..((((((({..............,(((((....((((((({...,,,....,,.,((((.(((((((..(((((((((........)))))).)))..))))))}.((((((..........)))))){{||||.{{{{{,,(((({{({.{{,(((((((.((.(((.((.{(((((((((.(((((((.((((((((.,,((((((((((((((...,....|.,{{((((((((((.........)))))}...((((((....))))))(((((((((((......)))))))))))..(((((.((((.((((....)))).)))).))))},(((.(((((,,,.....,,.}},...........((((((((.({,,,.....|||...........,,...((((((......)))))).}..)).))))))))))))).))))........,.}}))))),}}...))}}),}))))))))),(((,{((,...{(({,.||,.((((......)))),}}}...},,,..((((((((.......))))))))|||.}}))}.,,.)))))..))).)))))))..((((....))))....((((((.....)))))){{(.(((((((((((((((((((((((((((...((({....})))..))))))).((((((..(((.(.(((.....(((((,{,,.((((((....(((((.((((((.(((.,....}))).)}))))).)))))...))))))..,|||,...((((((.......))))))}}},((((((((((((((((((((.............))))))){,.(.(((((.......))))).}},..(((((..(((((........)))))...))))).......((((((....)))))).{{{.((((,..((((((.{(((.,,((((({((,,,,.,}|(((((((((,{(.((((((((((.(((((...((.((((,,...,,..{....,...,..))},.)))).))...))))))))))....{,....,..|||....,},...))))).)))))))))))((((((......)))))).((((((({((((((({{((((((........,.,((((((..,,.,(((((((...((((......,..)))).))))))).,.,}.))))))...,....{((((....))))}{(((((.((......)).)))))}...)))))))))))))).}.,.))}||||{{({{,...,||.,,,(,,(({{{{,..|||||,,,..((((((...(((((....))))))))))).,},..}}...}}))))))))}.||.....}}},,.,}|||||},.,}}},,.,,,.,,|,,{,.(((((((((........))))))))).})}..,,,...})))).,.,)))}.))))))...((((..,..{((.((((.((,(((((...))))))).)))).))).....))))...})))).)}}(((.((((((((......)))))))).)))....)))))))))))))....)))))...)))).)))..))))))..)))))))).))))))..})))))..))}...((((.(((.(({(({(.......)))))).))).))))....,{{,(((......)))..,,,.)))))))))}.)).)))...)).))))))).{|||||||,,...........,,||}|||||,,,..,}))))}|}......,,,.)))}}}((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((((.(((((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((......(((((((((((.((((.((((((..(((.(((((((((((((((((...(((((((.((((((.(((((((((((.(((.(((((((.(((((((((((((((((.((((((((((((((.((((((((((((..((({.((((..((.((((((((((({.(..(((((((,,.(((((({{.,,,((((,.{{{,..,{{,|{{||{{{{{{.((((((((.,((((((((((((((((..,,........,..))))))))))))))))|,(((((,({((.,,,|}||,|||{|||(((((....))))).....,{,.|||||}||||.}}},.)),)..,)))).)),((((...........)))).))))))))..},,})}.}}}.,}},....})))}....))))))))))))))))..).))))))))))).))..)))).,,))).)))))},)))))))))))))))))))).))))))))))))))))).))))))).))).))))))))))).)))))).)))))))...))))))))))))))))).)))..)))))).)))).)))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))...(((((((.{...........}.))))))),,,,..))))))))))))....)))))))))))))....))))))))....})))}}{{{.....,)))..,,,||||{{|,,,.}})))))}}))))))),.,))))))))..))))))...}))..))))..}))))))))).)))))))))))..))......))).)))))..{((((((((.(..(((((....)))))..).))))))))))))))))))))).,..,..)))).}}.))))))))))((.((((.,..((((({,(......}))))))..}.)))).))....(((......))).}))))))....}}}.}).))))))}))))..))))))))),,{{......|,,,........,.,,.....,,,,,,.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCGGCUCGGUUCUCCCGCCUCCGCCUCCGCCGCGGCUCGUGGUUGUCCC… 4099 nt 0.4394
GCGGCUCGGUUCUCCCGCCUCCGCCUCCGCCGCGGCUCGUGGUUGUCCC… 4005 nt 0.4380
Summary

Posttranslational modification of proteins by the addition of the small protein SUMO (see SUMO1; MIM 601912), or sumoylation, regulates protein structure and intracellular localization. SAE1 (MIM 613294) and UBA2 form a heterodimer that functions as a SUMO-activating enzyme for the sumoylation of proteins (Okuma et al., 1999 [PubMed 9920803]).[supplied by OMIM, Mar 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the ubiquitin-mediated proteolysis pathway in cortical microglia, with the UBA2 being among the numerous ubiquitination-related genes affected [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].