Basic Information

Symbol
UBAC2
RNA class
mRNA
Alias
UBA Domain Containing 2 RP11-178C10.1 PHGDHL1 Ubiquitin-Associated Domain-Containing Protein 2 Phosphoglycerate Dehydrogenase-Like Protein 1 Phosphoglycerate Dehydrogenase Like 1 UBA Domain-Containing Protein 2 FLJ30548
Location (GRCh38)
13:99200758-99386504
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001144072.2
Sequence length
2259.0 nt
GC content
0.4967

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-785.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -827.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 416.9
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((((.((.((((.((((....)))).))).)...)).)))..((((((((((((((..((((((((.((((.((....)).))))))).....)))))...)))))))((((.((.(((((((((((((((((.(..((((((.((....(((((.((((((((((((((.........)))))((((((..(((((((((....)))))))))....(((((.......)))))))))))..(((((...)))))(((((...(((((((...(((..((((((.....))))))....)))...)))))))....)))))(((.....(((((((.((((.((((((((.((......((((((((........))))...((((((..............))))))(((((.(((((.......))))).))))).(((((..((((((((((.((.(((((((.(((((.........(((((((.(((((.....(((.((((((((((.(((((.((..(((....))).........(((((..(((((.....(((((..(((.....(((((((((((((((((..(.(((((....))))).).)).)))))))...........)))))))).))))))))..)))))..))))).))))))))))...........))))).)).)))((((((((.(((.((((.............))))..)))...)))))))).)))))..))))).)).......))))))))))))((((((((...))))))))......(((((...........)))))))))))))).)))..)))))((((((((((........))))).....)))))......))))))))))))))...........(((((.(((((.......))).).).)))))((((.(((....)))))))..))))..)))))))....)))...(((..(((((((((......)))))))))))).)))))))))......((.((((..(((((((((........(((....)))(((...(((((((.......))))))))))(((.((((((.((((.(((((((((((...((((((.(.(((((((((((((.......))))))).)))))).)((((((((...((((((((............))).)))))..))))))))(((.((((((((..((.((.(((..(((((.(((((...(((..(((((((((.....(((((((...((.(((((((((((.......)))))))..)).)).))...)))))))...))))))))))))))))).)))))))).)).))....))))))))...)))..((((((.(((((((..(((((..(((.((((.(((((..(....)..)))))((((.((((((.............((((..((((..(((....))).))))..)))).((((((.((((((((((.(((..((((.(.............).)))))))))))))))))..))))))))))))))))....)))).)))...)))))....)))))))..))))))(((.....))).......))))))...)))))))))))..(((((..((((((....)))).))..)))))((((((((((...........)))))))))))))).)))))).))).....(((.((((((.........((((((.((((((((((.....))))..))))))...((((.(((((((((.....)))).)))))))))(((.(((.......))))))))))))(((.(((((.((.((((((..(((((.(((....((((((...))))))...)))....)))))..)))))))).)))))...))))))))).)))))))))))).)))))).)))))...))))))))..))).)))))..))))))))))...)).))))(((....))).))))))).........)))))..(((((((.(((((...)))))......(((((........)))))....(((((((...))))))).......(((((((.((((......))))..))))))).............((((...(((...)))...))))......(((((......))))).............)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
........((((({{{.(({((((.((((....)))).))).)...)).)))..((((((((((((((..((((((((.((((,({....)),}))}))).....)))))...))))))}((((.((.((((((((((((((({{.{,.((((((.{(....(((((.(((((((((,((({.......||)})}|((((((..(((((((((....)))))))))...,|||||,......,},.,))))))..(((((...)))))(((((...(((((((...(((..((((((,...,))))))....)))...)))))))....)))))(((.....(((((((.((((.{{{,,((({(,......||||.,,,,{{{{,..|||{{{.((((((..,.{....}.}..))))))(((((.((({{,,,....))))).))))).{(((({{({{(((((((,{{.(((((((.(((((.........(((((((.(((((.....{((.((((((((((.(((((.{{..(((....))).........,((((..(((((.....(((({.,(((.....(((((((({((((((((,,{.(((((....))))).}.)),))))))},,......}}})))))))).}}})))))..)))))..))))}.})))))))))...........))))).)).))}((((((((.(((.((((.............))))..)))...)))))))).)))))..))))).))..,....))))))))))))((((((((...))))))))......(((((.,......,..)))))))))))))).}))},})))|((((((((((,.....,.})))}....,))))),,{{{{||,,,,,,,,,,))}}},,......(((((.(,(((.......))).}.}.))))){{{{.||,,,,,))))))),.))))..)))))))....)))...(((..{((((((((......))))))))}))).)))))))))......{(.((((..(((((((((........(((....))){{{...(((((((.......)))))))}}}(((.((((((.((({.(((((((((((...(((((({,.(((((((((((((.......))))))).)))))).}((((((((...((((((((............))).)))))..)))))))),((((((.,,.,{{(((((((((..,{,,{{({{{(.{{,,.{{,(({({{{{{,,,{{{,,......,..(((,,..,{|||,,,|{{||||}|}||}}.,|{{{{({{||{{{{{{..,))))))))))))))).}}},.,,}|||.}},|.|}}}))))},..,|{{.(((,,{,,,,,||,.}|||||,,(((|{,||.{{{,{||{|||.|..||,,(((((.((((((..,{,......,.{(((..((((..(((....))).))))..)))}.((((((.(((((((((((((({..(((.{.............),)))))))))))))))))..)))))))}))))))))}.}}}},,.)))}..)))})},..)))))))..,))))).})).)}})))))}..}.})))))...)))))))))))..,((((.,((((((....)))).)),.))))|((((((((((...........)))))))))))))).)))))).))).....(((.((((((.........((((((.{(((((((((.....))))..))))))...{(((.(((((((((.....)))).))))))))){{(.(({.......))))))))))))(((.(((((.((.((((((..(((((.((,.,..((((((...))))))..,),,.}..)))))..)))))))).)))))...))))))))).)))))))))))).)))))).)))))...)}))))))..})}.)))))..))))))))))...)).))))(((....))),))))))).........)))))..(((((((.,(({{.,,||}}}.,{{..(((((........))))),,,.(((((({...})))))).....{,({(({((,((((,.,...}}}}..}))}}))}}...,,,....,|||{...{{{...})}...))))......(((((......))))).....,.......)))))))....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001144072.2 NCBI
GCACUUCAGCUUCCCCUCCCCCGGCGCCCUCUGGGGCUCCGAGCCCGGC… 2259 nt 0.4967
NM_177967.4 NCBI
GCACUUCAGCUUCCCCUCCCCCGGCGCCCUCUGGGGCUCCGAGCCCGGC… 2657 nt 0.5401
Summary

Predicted to enable serine-type endopeptidase activity. Involved in negative regulation of canonical Wnt signaling pathway and negative regulation of retrograde protein transport, ER to cytosol. Acts upstream of or within protein localization to endoplasmic reticulum. Located in endoplasmic reticulum. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.