Basic Information

Symbol
UBAP1L
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Associated Protein 1 Like Ubiquitin-Associated Protein 1-Like UBAP-1L
Location (GRCh38)
15:65092760-65115200
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001163692.2
Sequence length
1707.0 nt
GC content
0.6157

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-715.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -742.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 493.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001163692.2 NCBI
AUUCAUUUAUACACGCUUUGUCUGCAGGGAAGUUCUCCUGGUAAUUACA… 1707 nt 0.6157
Summary

Predicted to enable ubiquitin binding activity. Predicted to be involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway. Predicted to be part of ESCRT I complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human patients identified the UBAP1L as the most down-regulated mRNA in myocardial fibrosis after acute myocardial infarction [Wang et al. DOI:10.2147/IJGM.S329391], and a separate study found it was upregulated in heart failure compared to myocardial fibrosis [Wang et al. DOI:10.3389/fcvm.2021.664044].