Basic Information

Symbol
UBASH3B
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Associated And SH3 Domain Containing B TULA-2 STS-1 T-Cell Ubiquitin Ligand 2 KIAA1959 TULA2 SH3 Domain-Containing 70 KDa Protein, Suppressor Of T-Cell Receptor Signaling 1, Nm23-Phosphorylated Unknown Substrate Ubiquitin-Associated And SH3 Domain-Containing Protein B Suppressor Of T-Cell Receptor Signaling 1 Tyrosine-Protein Phosphatase STS1/TULA2 Cbl-Interacting Protein P70 STS1 Nm23-Phosphorylated Unknown Substrate Cbl-Interacting Protein Sts-1 EC 3.1.3.48 P70
Location (GRCh38)
11:122655722-122814473
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032873.5
Sequence length
6865.0 nt
GC content
0.4315

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2077.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2212.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1772.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363365.2 NCBI
AUUGCAAAUUCCCGGACUGCUAGGCGAGGAGAGGGAAGGGGGCGGAGGA… 6869 nt 0.4315
NM_032873.5 NCBI
AUUGCAAAUUCCCGGACUGCUAGGCGAGGAGAGGGAAGGGGGCGGAGGA… 6865 nt 0.4315
Summary

This gene encodes a protein that contains a ubiquitin associated domain at the N-terminus, an SH3 domain, and a C-terminal domain with similarities to the catalytic motif of phosphoglycerate mutase. The encoded protein was found to inhibit endocytosis of epidermal growth factor receptor (EGFR) and platelet-derived growth factor receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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