Basic Information

Symbol
UBC
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin C Polyubiquitin-C HMG20
Location (GRCh38)
12:124911604-124917368
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021009.7
Sequence length
2193.0 nt
GC content
0.5226

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-755.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -795.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 719.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_021009.7 NCBI
AGUUCCGUCGCAGCCGGGAUUUGGGUCGCAGUUCUUGUUUGUGGAUCGC… 2193 nt 0.5226
Summary

This gene represents a ubiquitin gene, ubiquitin C. The encoded protein is a polyubiquitin precursor. Conjugation of ubiquitin monomers or polymers can lead to various effects within a cell, depending on the residues to which ubiquitin is conjugated. Ubiquitination has been associated with protein degradation, DNA repair, cell cycle regulation, kinase modification, endocytosis, and regulation of other cell signaling pathways. [provided by RefSeq, Aug 2010]

Forensic Context

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