Basic Information

Symbol
BMP4
RNA class
mRNA
Alias
Bone Morphogenetic Protein 4 BMP2B Bone Morphogenetic Protein 2B BMP2B1 MCOPS6 BMP-2B OFC11 BMP-4 ZYME DVR4
Location (GRCh38)
14:53949736-53958761
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001202.6
Sequence length
1931.0 nt
GC content
0.5396

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-695.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -726.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 628.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001202.6 NCBI
GGAAGAUGCGAGAAGGCAGAGGAGGAGGGAGGGAGGGAAGGAGCGCGGA… 1931 nt 0.5396
NM_001347912.1 NCBI
GGAGGGGCCGCCGGGGAAGAGGAGGAGGAAGGAAAGAAAGAAAGCGAGG… 1735 nt 0.5320
NM_001347913.2 NCBI
GGAAGAUGCGAGAAGGCAGAGGAGGAGGGAGGGAGGGAAGGAGCGCGGA… 1878 nt 0.5426
NM_001347914.2 NCBI
AUUCCGUAGUGCCAUCCCGAGCAACGCACUGCUGCAGCUUCCCUGAGCC… 1650 nt 0.5188
NM_001347915.2 NCBI
AUUCCGUAGUGCCAUCCCGAGCAACGCACUGCUGCAGCUUCCCUGAGCC… 1597 nt 0.5216
NM_001347916.1 NCBI
GGGCGCCCGCGGCCUCCGCACCCGGACCUGAGGUGUUGGUCGACUCCGG… 2080 nt 0.5418
NM_001347917.1 NCBI
GGGCGCCCGCGGCCUCCGCACCCGGACCUGAGGUGUUGGUCGACUCCGG… 2027 nt 0.5446
NM_130850.5 NCBI
GGAGGGGCCGCCGGGGAAGAGGAGGAGGAAGGAAAGAAAGAAAGCGAGG… 1788 nt 0.5291
NM_130851.4 NCBI
AGACGCAGACGCAGAGGUCGAGCGCAGGCCGAAAGCUGUUCACCGUUUU… 1723 nt 0.5229
Summary

This gene encodes a secreted ligand of the TGF-beta (transforming growth factor-beta) superfamily of proteins. Ligands of this family bind various TGF-beta receptors leading to recruitment and activation of SMAD family transcription factors that regulate gene expression. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate each subunit of the disulfide-linked homodimer. This protein regulates heart development and adipogenesis. Mutations in this gene are associated with orofacial cleft and microphthalmia in human patients. The encoded protein may also be involved in the pathology of multiple cardiovascular diseases and human cancers. [provided by RefSeq, Jul 2016]

Forensic Context

A study in cynomolgus macaques demonstrated that the BMP4 mRNA expression was significantly upregulated in the hippocampus following both acute and chronic methamphetamine administration compared to controls [Choi et al. DOI:10.1016/j.taap.2018.05.031]. In a porcine model of myocardial infarction, the BMP4 gene exhibited opposite regulation, being repressed in the border zone but induced in the ischemic zone of the heart [Kaikkonen et al. DOI:10.1161/CIRCGENETICS.117.001702].