Basic Information

Symbol
UBE2N
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Conjugating Enzyme E2 N UbcH-Ben UBC13 Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2N (Homologous To Yeast UBC13) Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2N (UBC13 Homolog, Yeast) Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2 N E2 Ubiquitin-Conjugating Enzyme N Ubiquitin Carrier Protein N Ubiquitin-Protein Ligase N MGC8489 UbcH13 Bendless-Like Ubiquitin Conjugating Enzyme Bendless-Like Ubiquitin-Conjugating Enzyme Epididymis Secretory Protein Li 71 Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2N Ubiquitin Conjugating Enzyme E2N Yeast UBC13 Homolog UBCHBEN; UBC13 EC 2.3.2.23 EC 6.3.2.19 HEL-S-71 UBCHBEN Ubc13 BLU
Location (GRCh38)
12:93405673-93442258
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003348.4
Sequence length
4877.0 nt
GC content
0.3951

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1375.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1473.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1190.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003348.4 NCBI
ACUCGUGCGUGAGGCGAGAGGAGCCGGAGACGAGACCAGAGGCCGAACU… 4877 nt 0.3951
Summary

The modification of proteins with ubiquitin is an important cellular mechanism for targeting abnormal or short-lived proteins for degradation. Ubiquitination involves at least three classes of enzymes: ubiquitin-activating enzymes, or E1s, ubiquitin-conjugating enzymes, or E2s, and ubiquitin-protein ligases, or E3s. This gene encodes a member of the E2 ubiquitin-conjugating enzyme family. Studies in mouse suggest that this protein plays a role in DNA postreplication repair. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human body fluids demonstrated that the UBE2N was identified as a body fluid-specific housekeeping gene, showing stable expression in vaginal secretion samples aged under indoor conditions [Salzmann et al. DOI:10.2524].