Basic Information

Symbol
UBE2S
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Conjugating Enzyme E2 S E2-EPF Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2-24 KDa Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2-EPF5 Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2 S E2 Ubiquitin-Conjugating Enzyme S Ubiquitin Carrier Protein S Ubiquitin-Protein Ligase S E2EPF Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2-24 KD Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2S Ubiquitin Conjugating Enzyme E2S Ubiquitin Carrier Protein Ubiquitin-Protein Ligase EC 2.3.2.23 EC 6.3.2.19 E2-EPF5 EPF5
Location (GRCh38)
19:55399745-55407788
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014501.3
Sequence length
2559.0 nt
GC content
0.5572

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1014.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1060.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 872.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((...((((((.(((((((((.((((.(((((...(((((..(..(((.((((((.((..((((((.((..(((...(((((.(.(((((.....))))).).)))))....)))..)).)))))).))..))))))..)))..)..)))))....))(((((((((......)))))))))(((....))).....(((((...))))).))).))))))))..........(((.(((((.(((..((((((((...(((.((((((....((((((((.....(((((((((.......)))))))))....((((....)))).)))))).))(((((..((((((((((.....))).))))......(((.((...)).)))((((((.((.(......)))))))))))).))))).......((((..(((((((((((......)))))((((...))))))))))..))))....(((.((((.....((((.(((((((((((....))..(((.(((.((((.((....((((((((((..((((((((..((((((((....))))...(((((((((((((((.(((((((.(.......).))))))).)))))))((((((((((((((..............)))))..))))))))).((.((..(((((..(((.....)))..))))).)).))......)))))))).......((((((.(((...))).)))))).))))...)))))....(((((.........((((((..............)))))))))))..........))).....))))))))))..)))))).)))))))))))((((..((((((....(((((((.((((((...((((((((((((((....(((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))))))...))))))))...((.(((((...(((((((((((......)))))))))))((.((((((...)))))).)).))))).))((((((..((.(((((.((((..((((((...)))))).((((..((((...))))..)))).)))).))))))))))))).((((((.......))))))((((...))))...)))))).)))).)))((((((((.(((((((((((((((((((((((((.....((((((......))))))......((((((.((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((..(((((.......(((......))).......))))))))))))......))))))))).).)))))).).))))(((((((((((((((..(....(((.(..((((((.(((((((((....)))))))))....)))))).).))))..))))))))))..)))))((......)).((((((.((((.....))))))))))(((...((((.....))))..)))(((((...))))).....((((((.((.(((((((((..(((...((((((.(....(((((((........)))))))....).))))))..))).))))).))))..)).))))))......)))))))))))))))))......))))).)))))).(((((..((((.((((...((((...(((((......))))).))))...((((((((...............))))))))((((((((((((.((.....((((((((.(((((................(((((.........))))).(((((...))))).)))).).))))))))..))))))))))))))(((((((.(((((((....)).)))))(((((((((...)))))))))......(((((((.((((((((((((....))))..((((((((...))))))))))))).))))))))))..(((....)))..)))))))...)))).)))))))))...(((((.(((((.(((.(((.(((......(((((((..((.(((((((...))))).)).....(((((.....)))))...............))..)).)))))....((((.....))))...(((((.((((((......(((((......))))).)))))))))))((((((((......))))))))...(((((......))))).))).)))))).))))).)))))...((((((.......))))))..((((..((......))...))))))))))))))).))).)))))))).)))))))))).(((((......)))))..((((....))))..............)))).)))).....)))).))))))))).)))))))).))).))).))))).)))...(((.((..(((((....)))))..))...)))..)))))))).)))....))))))............(((.(((.((((.......))))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.(.(({{((((((((((((((.(((,.{(((({{(((((,(((.((((.(.{.((((((..(((.(.((........))).)))..)))))}...}}})))).)))))))).)}}}))))))))))))),,,,||,,({|{((.(((((((((,{{{{(((((((((......)))))))))(((,,,,|||.,,..(((({...})))).,||{{|||{(({,,.,{{,,{.{{{|||{{,.,,((.((((..,,},}},,||((({(({{.,,((((((,....((((((((((,....,||}}}}))}....((((,,,,|}}}.}}|}}}.|(((((,,.{|||{|||{{...,,))),)))),,},,.{{{.{{...}),)}}{{|||||||,|,,...,)))|||||,,,,.|||||..,....((((,.(((((({((((......))))}((((...))))))))))}.))))..}||||,..{((((,{{((,.((((((((((((.({{,{.((.(((({..{{,,..,},})))),})||}.,,,..,|,.{((((((({....))))...((({(((((((((((.(((((((.{.......).))))))).)))))))((((((((({((((.,.|.......,,,))))}..)))))))))..,{,({{(((({..,,}..)}}))))))|||({{{,|.,||,..}}}))))),.....((((((....)))))){{|{{{||||||||,,{|||,{|{{,{{(|{,{.(((,,((({({,{{(,,.,...,..|}|{|}||,|,.,,...,((,(((,..{,|(|(({({({{{{|,,.)}))})},|||||{||||,|||,||,...{||{|||,|{{{{{,,((((.((((((((...{{{(((,(,,{,{{({,,.....,.),)))}))))}.)))))))).))))|(((((((((((({{(((.{(((((((((((......)))))))))))}..))||.))),),))).)))))}.((((((((((.{({{.(((((.((((..((((((...)))))).((((.,((((...))}),,)))).)))).)))))})},}})))))}}}))),,,..}}}}.}||||..,)))}...)})))).)))))}||((((||||.,,||}||||}((((.(((....})).)}}}{(((((......}))))}......{|||||.|||||{{{|||||{{{.((((((.(((((((((((((((((..(({{(,,,....,,|,,,..,}}}.,,,...})))))))))))......))))))))).).)))))).|||||}...}}||||{((((....)))))}}})}}|{{|||.(((((((((....)))))))))....}}}}}}..{(((,,((..{(((((...{{,..((.....,)|.((((((.((((.....)))))))))).,....},,)))))})))))))..{{|||,,,))))).....((((((.((,(((((((((..{{{.,,||||{{.|....(((((((........)))))))..,.,.)))))}..}}},))))).}))).,)).)))))).,,,.})))))))))))}}}}}},,||,|||||},.||||{...,}}},||{|,{|{|}}}}|||}..,((((......)))))}))))}},||||||(({{..{{{,{{{{{{,|||||||},{{{{{{{{{||.||,,...,{{||||||}}||}}...))}}........(((((.........))))).||||}..})))))}))))))))}}}))}},,))))))}})))))}(({{{{,.|||||||.,},})})))))|||||((({...|))))}}}}......{({(({{.({((,,,,{(((....)))}..{(((((({...}))))))),,||||||}}|||}},..{||....)))},}}}}|||.,,,.,,{{{((((,.,(({(((((,({(((,(((.(((.,{{...,,,{{{|||..}},.||{(({|,,,))))).,,.....(((((.....))))).........,,,,..}||||}.}|,.,.}},((((.....))))...(((((.((((((...,,,(({{{......})))}.})))))))))}((((((((......)))))))).,.,{(((..,,..))))),}}|,}}}}}|,}}}}|,}}}}}...((((((.......))))))...|,,.,.....,}|||,,,|}||,}},}}}}}},}.))})})))))).}}})),.}},.{{|||.,,...)))))},{{{{,,,.||,}.....,......,}))}}..}}},}...,))}..,,})))))))).)))))..)).{{{({,{|..|||{{.,.......|||||..,,})))),)))))))))).)))))))),,{{....,.||||,....,}}}}.,(((.(((.{{{{.......}})}))).))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014501.3 NCBI
GGCUCAGUGCUGCCGGGCACCGGGGCGGCGGGUUGGUCUACGCUGUGCG… 2559 nt 0.5572
Summary

This gene encodes a member of the ubiquitin-conjugating enzyme family. The encoded protein is able to form a thiol ester linkage with ubiquitin in a ubiquitin activating enzyme-dependent manner, a characteristic property of ubiquitin carrier proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human body fluids demonstrated that the UBE2S was identified as a body fluid-specific and stable housekeeping gene in semen samples aged under indoor conditions [Salzmann et al. DOI:10.2524].