Basic Information

Symbol
ULK1
RNA class
mRNA
Alias
Unc-51 Like Autophagy Activating Kinase 1 ATG1 ATG1A Serine/Threonine-Protein Kinase ULK1 Autophagy-Related Protein 1 Homolog EC 2.7.11.1 HATG1 ATG1 Autophagy Related 1 Homolog (S. Cerevisiae) Unc-51 (C. Elegans)-Like Kinase 1 Unc-51-Like Kinase 1 (C. Elegans) ATG1 Autophagy Related 1 Homolog Unc-51-Like Kinase 1 EC 2.7.11 KIAA0722 Unc51.1 UNC51
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_003565.4
Sequence length
5322.0 nt
GC content
0.6422

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2352.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2435.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1409.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((((((.(.(((((((...(((((.(((((((((((((.((((((((((......)))))....(((((((.((((((.((((((((.((.((.......)).))))))).))).))))))..)))))))))))).)))))))).(((((((((.((((.......)))))))....))))))...((((((((((((....(((....))).((((....))))((((((..((((....(((....)))))))..)))))).)))))))))))).....(((......)))...))))).))))).))))))).).)))))))...)))))))........((((((((((...(((((((....))...)).))).)).))))).))).(((((.((((((.(....(((.(((((......))))).)))..).)))))).((.(((((((((((...........)))))))))))..)).......(((((((((((((....((((((.(((((.((((.((((((..((((((......)))))).((((........)))).....................((((((.((...((((..(..(((((....(((.......)))..)))))....)..)))).)).))))))((((((((...(((.....((((((((((((..(((.((((((((((..((((.(((..((((((((((((.((((((.....(((..((((.(((...))).))))..)))...)))))).)))..((.((((......)))).))........((((((.(((((((.((((....(((((((........))).)))).....)).)).)))))))...(((((((((..(((.(((((.....((((((.((((((((((((..((((((((((((((.(......((((..(.....)..)))).((((((((...(((((...(((((............))))).((((((((..((((.((((((((((.(((((..((.(((((.((((.((((((......)))))).).))).)))))...........((((.(.(....))))))....))..)))))((((((((....(((...)))......(((...((.(((.(.((((.(((...............))).)))).)))))).))).)))))))).....((((.(((.((((((((.(((..(((......)))..).((.(((.(((.....))).))))).((((..(((((((((.((((((.((((.(((((((((((((...)))))(((.((....(((((..((((((.....((((((((...((((((((((((((.....((((((((..((((((.....((((((.((((((....)))).)))))((((((((.....(((((...(((((((..(.(((((...)))))...)..)))))))...)))))...))).))))).....((((((((...(((((((..((((((((...((((((.(((...............((((.((..(((.....)))..))))))..))))))))).))))))))((((.(((((...))))))))).................(((.((((......)))).)))............)))))))....))).))))).....)))....)))))))))))))).(((((((((((((....(((((...)))))..(((.((((.((...)).))))..)))...(((((.(((.((.((((.(((((((.(((((.((((((.(((((.(((((((((((..........(((.......)))..........)).)))).))).((((.((....)))))).....(((((((..((((.((((........)))).))))..))))))))).))))))))..........)))))))).))))))).)))).))))).)))))........))))))))))))).....(((((.......................)))))..))))))))))))))............))))))))......))))))......(.((((((((((....)))..))))))).)........((((((......((((((((....(((((((((.((..(((((((((.(((...((.(((((((..((((...(((..........((((((((.(......(((((.(((.((((....((((..((((((.......))))))........))))..(((((((((((((...)))))((((((...(((.((...(((.(((((.(((.(((((....))))).)))..))))).))).))..)))..)))))).........(((((((....((.....))....)))))))(((((((........))))))).))))))))..)))).))).))))).((((((....(((........)))....))))))...(((..((((....))))..)))).)))))))).....((((........(((((.....))))).((((.(((((......)))))...))))...((((((((..((((((((.((......((((((....(((((...))))).......))))))))))))))))..))))))))..(((((((..((((((((((((.....))).))))....)))))..)))))))...........))))......(..(((((((.(((...))).)))))))..)((((.(((((....))))).))))..((.((.((((.((...)).))))))))(((.....)))((((((....)))))).)))..))))..))))))).))..))).))).)))).)))).)))))))))............))))))))((((.((((((((..(((......(((((((((((((...((((.((((.((((.(((((....))))).)).......(((((((........)).))))).)).)))).))))...........((((((((((((((.(((((.((((((((........))))).)))))))).....))))).....(((((((...((((((..(((.((.((.((((.((..((((((((...((((((.(((..(((((.((((..(((...(((.((((.((((((((((..((.((((.......))))...))..)))).)))))).)).)).))).(((((........)))))...((((.((((...))))))))...)))...)))))))))..))).)))))))))))))).)).))))..)).)).))).))))))((((..(((.((.((((((.....))))))....)).)))))))(((((((((....))))...)))))........)))))))(((.((((.....)))).)))((((((........)))))).....((((((((...(((..(((....(((((.((((....((((....)).))....)))).))))))))..))))))))))).)))))))))....((((((...(((((((((...((((.(((.((((......)))).))).)))).((((((((.....))))))))..........)))))))))...)))))).)))))))))))))...))))))))))).)))).(((....)))..((((((((((.(.((..((((..((((..((((((((((.....((.(((((......))))).))...)))).((((((.((..........)).)))))).((((((((((.(((((.(((((.((((((((((((.(.(((....(((....((((.(........).)))).((((((....)))))).(((..(((((......)))))..)))(((((((((((((((.(((....)))..(((((((((.((....)).))))))))).(((..((((.......))))..)))..)))....))))))))))))...)))..))).).))))))...))))))..))))).)))))....))))).)))))...)))))))))).))))..)).)))))))))))...)))))).)))))...)).))))))).)))).((((((((.(((.....................))).)))))))).(((((((.(((.((((..((((((((...))))))))..)).)).))).))))))).......)))).)))).))...)))))))))..))))..)).)))))))).))).))))((((.(((.((((.((((.(((((((((((.(((.((........(((((((........))))))))).))).)))))))))))...)))).))))))).))))))))))))))...((((((......))))))...................))))......)))))))).((((..((((.(((....)))))))))))..((((.(((((((((((..((.(((...((.((((((.((.....(((((....))))))).)))))))).)))))...)))))))))))))))...(((((((((..(((...)))...)))))))))).))))...))))))))..).)))))....(((((((((......((((((((((....)))).....))))))...)))))).))))))))))))....)))).)))))))).))))))....))))))))...(((.((((((((((....)))))))))).)))((((((.......)))))).....)))))((((((((..((((((............)))))).((((((...))))))...........((..((.((.((((...(((.....)))..)))).)).)).))....))))))))))))..)))))).)))))))))....))).)))).....))))))..)))).....)))..)))))).)))))))))....))))))))(((((.(......).))))).))).)))..))))))))).))))))..)))((((((.......))))).)......).)))))))))....(((((((((.((((....))))..)))))))))........)))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((({(((((((((((.(.(((((((...(((((.(((((((((((((.(((((,,,{({({...}))),.,,.(((((((.((((((.((((((((.((,({.......)),)}))))).))).))))))..)))))))))))).)))))))).{{(((((((({(((.....,.}}})))}....)}}))}{|.,,((((((((({..,,||||,,||}}.|{{{,..{||||((({((..((((.,..({{....)}}}})),.})))))})))))},,))))}},},))}}.}},}))),},))))).))))).))))))).).)))))))...))))))),,,.....((((((((,{,,.(((((({....,,...)).))).)).))))).))).(((((.((((((.(..{.(((.(((((......))))).))).,}.)))))).((.((((((((((({{....,)}..)))))))))))..)).......(((((((((,{,{,...((((((.((((,,((((.((((((.,{(((((......)))))}.{(((........))))...,....,............((((((.((...((((..(..(((((....(((.......)))..)))))....)..)))).)).))))))((((((((...(((.....((((((((((((..(((.(((({((((({{(,,(.(((..((((((((((((.((((((..{,.{((..((((.(((...))).))))..}}}...)))))).)))..{(.((((......)))).)}........((((((.(((((((.((.({.,.(((((((........))).))))...,.)).)).)))))))...{{(,{{((,,{(((.(((((.....((((((.((((((((((((..((((((((((((((.{......{(((..{.....|..)))}.((((((((.,.(((({...(((((............))))).((((((((..(({{.{(((((((((.(((((,,{,.(((((.((({,((((((......)))))).).))).)))))..........,((((.,.,},}})|,,,|{||,||.,|||||((((((((,,..,({..,{,,..,.,.{((.,,{,.{((.....((((((....))))))....,|||||.|,,}}|,},.....)))))))),....{{{{.||{.|{{(((({.{{|,.{{{..,...)))},).||.|||,|||,,.,,))).))))).((((..(((((((((,({((((.((((.((((((((,(((,{.{||||,({{{({...{(((..{{(((((({....((((((,,.,,||{||||{{{{((({{{,,((({((((,,(({{..,,},))|}{||.|{((((....)))).}}))){{{(((((.....(((((...(((((((..{.(((((...)))))...,..)))))))...))))).,,))).))))).||,,|||({{((,.,{(({(((..(((((({{...((,,{{.||,..}}}}}}..}}}..||||}||..|||.},,,))),,))))))}}))),,)))).)})))}),))})),|,|||{{,|||{|{|{.......{{.(((((((,{.,(({{......}}}}{{(((.{{{{(({{,.,||||,|,...,,,|,|,||.....,,..{{{({((((,{(((,.,.(((((((((((((....(((((...)))))..(({.((((.{(...}}.))})..}))...(((((.(((.((.((((.(((((((.(((((.((((((.(((((.(((((((((((.,,.,.....(((.......))}......,.}})).)))).))),((((.((....))))))...{{(((((((..((((.((((........)))).))))..)))))),))}))))))))..,,,,.,..)))))))).))))))).)))).))))).)))))........)))))))))))))..{,,{((((......{{({{{{......{,,,.||,,..)})))),((((,,..}}}}.......,}}|}}||,,....,,(((({...}}|}|,{(((((((....))}..))))|||{|,.......(((((,.,....{{{|||||....((((((((({({{,,,(((((((.{({...{{.(((((((..((((,,,(,,....}||||.{{{(((((,{,.....(((((.(((.((((..{.((((..((({((,,,....}))))),,,.,...})))..(((((((((((((...))))){(((,,..,||,.(({{{(((.(((((.(((.(((((....))))).)))..))))).))).,,..)))},|||||....,.}}}.(((((((....({.....}}....)))))))(((((((........))))))).))))))))..)))).))).))))).((((((....(((........)))....)))))),}.(((..({((....))))..))),.)))))))),..,,{{{({,,,,{,.((((({...,))))).||((,(({{(......)))))...))))...((((((((..((((((((.((......((((((....(((((...))))).......))))))))))))))))..)))))))),.(((((((..((((((((((((.....)))},)))....)))))..))))))).,.........,|||,.....||.||||||{,|{,...})|.))}}}}}..}|{{{.(((((....))))).|||{(.((.((.((((.((...)).)))))))),,|}}}}|||}((({{{....)))))),))}..))))..))))))).))..))).))).))))}),)).))))))))).{{{{,{,....)))}))))((((.((((((((..{((....,.(((((((((((({.{..,({((((({{{((,{{{((,,,,}||||.||||,.|{{((({{,||}}}},,.|,,{||||{{|..,|||||||{.....,.,.,|{{{{((({{((((.(((((.(((((((({,...,},))))).)))))))).,...|||||{{,..((((({(,,.((((((,.(((,(({((.((((.((..((((((((.{{{{{{{{.(((..{((((,((((..{({.||{|...,{(,(({,{,{((({{((,({((,..,,,,||||..||},,|||}.}))||).|||||,,{{,(((({((.{.,|{,,||||,||||,,||||.{{||,,,)))}..}},...))))))))),.))).)))))})))))))).)).)))).,)}.)),))),)))}}}{{{,..{{{,||,{{(|{|,,,.,)))}}},,}.})}).)))))|||||||||}...||||...}))))........}}))}}}(((.((((.....)))).))){((({{.,,,,.,.)))))).,.},||||||{|}}}{||..(((....{|||{.(((({{,,{,({,.,.)},|}||,,.}}}.}))))))),.))})))))))),}))))))))...}||||||,,.|||||||{|,,,||,,.|||,||||,...,,|||},|||,||||{,(((((((.....)))))))),...,,,...,)))))))),,.)))))},))))))))))))).,,))})))))))).)))).|||.,.})))}}},,|||||||}.}||}}||||}.|||....((((,((((.....((.(((({......})))).))...)))).||||((.{{,,,,,,,{{,|..||||}|.((((((((((.(((((.(((((.((((((((((((.(.(((....({{....((((.(........,.)))).((((((....)))))).(((..(((((......)))))..)))((((((((((((,,,.{{,.{(((|{,{(((((((((.{{....,}.))))))))).{||..((((.......))))..))},})),}}},)))))))))))),..}))..))).).))))))...))))))..))))).)))))....))))).))))).,}))),,)))))}))))}}))}))}}}})))))}).)),}))}))))).)}}},},,)))).)))).((((((((.{{(,,,...........,,,....,}}.)))))))).(((((((.(((.((((..(((((((,...})))))))..)).)).))).))))))).......)))).)))).))...)))))))))..))))..)).)))))))).))).))))((((.(((.((((.((((.{((((((((((.{{({(({{......{{|||||}.....,,||}}},)))})))}))))))))))}...)))).))))))).)))))))))))))),..((((((......)))))){|.................,)))....}})))))))).{((,.{((({.(((....)))))))))))..{(((.(((((((((((..((.(((...((.((((((.(({{{..((,,.,,..,))))}).)))))))).)))))...)))))))))))))))...(((((((((..(((...)))...)))))))))).}))),..))))))))..}.)))))....(((((((((...,{.((((((((((....)))).....)))))).,,)))))).))))))))))))....)))).)))))))).))))))....)))))}},..,(((.((((((((((....)))))))))).)}}{(((((.......)))))).,.,})))))|||{{,,({{((((....,........})))))).{(((({...}))))}.........,.{{..((.((.((((...(((.....)))..)))).)).)).))....}}))))))}))),.)))))).)))))))))....))).))))}},}.)),}}}..}}},.....)))..)))))).)))))))))....))))))))(((((,{......),})))).)))},))..))))))))).)))))){{|||..,,,|}}}}......,}.,....,,).)))))))))...,(((((((((.((({....})))..)))))))))........)))))........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUGCGGCUGCGCGGGCGUCUCAGGCUCUGAGGCCCGGGCGCCGCGGCU… 5322 nt 0.6422
Summary

Enables identical protein binding activity; protein serine/threonine kinase activity; and small GTPase binding activity. Involved in several processes, including autophagosome assembly; protein phosphorylation; and regulation of autophagy. Located in bounding membrane of organelle; cytosol; and phagophore assembly site membrane. Part of Atg1 /ULK1 kinase complex. Is active in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the ULK1 in cortical microglia, where it is involved in autophagy and mitophagy pathways [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].