Basic Information

Symbol
UNC13C
RNA class
mRNA
Alias
Unc-13 Homolog C Munc13-3 Protein Unc-13 Homolog C DKFZp547H074 Unc-13 Homolog C (C. Elegans) Unc-13-Like 3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001080534.3
Sequence length
8880.0 nt
GC content
0.4011

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2317.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2491.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2226.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGAAAAGACUCAGCCGCAGCCGGCGAUGUGUGAAGUUCCCAGCACGCAC… 8880 nt 0.4011
AGAAAAGACUCAGCCGCAGCCGGCGAUGUGUGAAGUUCCCAGCACGCAC… 13709 nt 0.3841
Summary

Predicted to enable calmodulin binding activity and syntaxin-1 binding activity. Predicted to be involved in glutamatergic synaptic transmission and regulated exocytosis. Predicted to be located in presynaptic active zone. Predicted to be active in several cellular components, including axon terminus; parallel fiber to Purkinje cell synapse; and synaptic vesicle membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

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