Basic Information

Symbol
BMX
RNA class
mRNA
Alias
BMX Non-Receptor Tyrosine Kinase ETK PSCTK3 Bone Marrow Tyrosine Kinase Gene In Chromosome X Protein Epithelial And Endothelial Tyrosine Kinase Cytoplasmic Tyrosine-Protein Kinase BMX BTK-Like On X Chromosome EC 2.7.10.2 Etk/Bmx Cytosolic Tyrosine Kinase NTK38 Tyrosine Kinase EC 2.7.10 PSCTK2 NTK38
Location (GRCh38)
X:15464246-15556529
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_203281.3
Sequence length
2543.0 nt
GC content
0.4330

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-700.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -753.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 593.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320866.2 NCBI
AGCCAUUUCUGACCCGGCAGCCAGGAAAAUGUGAAACAAUUUGCUUCUG… 2540 nt 0.4331
NM_001721.7 NCBI
GGGAAUAUGAGUGAUGGUGCCUCAAAGCAGUAACUUUUUGCUUAGAGCU… 2511 nt 0.4253
NM_203281.3 NCBI
AGCCAUUUCUGACCCGGCAGCCAGGAAAAUGUGAAACAAUUUGCUUCUG… 2543 nt 0.4330
Summary

This gene encodes a non-receptor tyrosine kinase belonging to the Tec kinase family. The protein contains a PH-like domain, which mediates membrane targeting by binding to phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate (PIP3), and a SH2 domain that binds to tyrosine-phosphorylated proteins and functions in signal transduction. The protein is implicated in several signal transduction pathways including the Stat pathway, and regulates differentiation and tumorigenicity of several types of cancer cells. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.