Basic Information

Symbol
USP15
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Specific Peptidase 15 KIAA0529 UNPH4 Ubiquitin-Specific-Processing Protease 15 Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 15 Deubiquitinating Enzyme 15 Ubiquitin Thioesterase 15 Ubiquitin Specific Protease 15 Ubiquitin Thiolesterase 15 EC 3.4.19.12 EC 3.1.2.15 UNPH-2 Unph-2 Unph4
Location (GRCh38)
12:62260338-62417431
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001252078.2
Sequence length
14971.0 nt
GC content
0.3633

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3845.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4135.62 kcal/mol
Frequency: 3.65532e-205
Diversity: 4150.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006313.3 NCBI
AGUGGAAGAAGAUGGCGGAAGGCGGAGCGGCGGAUCUGGACACCCAGCG… 14884 nt 0.3634
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Summary

This gene encodes a member of the ubiquitin specific protease (USP) family of deubiquitinating enzymes. USP enzymes play critical roles in ubiquitin-dependent processes through polyubiquitin chain disassembly and hydrolysis of ubiquitin-substrate bonds. The encoded protein associates with the COP9 signalosome, and also plays a role in transforming growth factor beta signalling through deubiquitination of receptor-activated SMAD transcription factors. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 2. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

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