Basic Information

Symbol
USP36
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Specific Peptidase 36 KIAA1453 Ubiquitin-Specific-Processing Protease 36 Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 36 Ubiquitin Specific Protease 36 Deubiquitinating Enzyme 36 Ubiquitin Thioesterase 36 FLJ12851 EC 3.4.19.12 EC 3.1.2.15 EC 2.3.2.- DUB1
Location (GRCh38)
17:78787381-78841441
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001385174.1
Sequence length
5872.0 nt
GC content
0.5588

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2190.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2291.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1336.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001321291.2 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 6208 nt 0.5699
NM_001385169.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 3925 nt 0.5697
NM_001385170.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 6216 nt 0.5698
NM_001385171.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 6329 nt 0.5736
NM_001385172.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 6047 nt 0.5543
NM_001385173.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 3922 nt 0.5696
NM_001385174.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 5872 nt 0.5588
NM_001385175.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 5895 nt 0.5586
NM_001385176.1 NCBI
AAUUCCGAAGAGCCAUUUCCUCGGCAGCCCCAGGCUUUGGCCGAUCGCU… 5995 nt 0.5593
NM_001385177.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 3660 nt 0.5719
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

This gene encodes a member of the peptidase C19 or ubiquitin-specific protease family of cysteine proteases. Members of this family remove ubiquitin molecules from polyubiquitinated proteins. The encoded protein may deubiquitinate and stabilize the transcription factor c-Myc, also known as MYC, an important oncoprotein known to be upregulated in most human cancers. The encoded protease may also regulate the activation of autophagy. This gene exhibits elevated expression in some breast and lung cancers. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

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