Basic Information

Symbol
USP36
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitin Specific Peptidase 36 KIAA1453 Ubiquitin-Specific-Processing Protease 36 Ubiquitin Carboxyl-Terminal Hydrolase 36 Ubiquitin Specific Protease 36 Deubiquitinating Enzyme 36 Ubiquitin Thioesterase 36 FLJ12851 EC 3.4.19.12 EC 3.1.2.15 EC 2.3.2.- DUB1
Location (GRCh38)
17:78787381-78841441
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001385174.1
Sequence length
5872.0 nt
GC content
0.5588

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2190.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2291.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1336.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001385178.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 5610 nt 0.5597
NM_001385179.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 3731 nt 0.5696
NM_001385180.1 NCBI
AUGGUGCGCGUGCUGGGCCGCGGGCCGAAGGAGUCGCCAGGGCUGCGUA… 5761 nt 0.5586
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

This gene encodes a member of the peptidase C19 or ubiquitin-specific protease family of cysteine proteases. Members of this family remove ubiquitin molecules from polyubiquitinated proteins. The encoded protein may deubiquitinate and stabilize the transcription factor c-Myc, also known as MYC, an important oncoprotein known to be upregulated in most human cancers. The encoded protease may also regulate the activation of autophagy. This gene exhibits elevated expression in some breast and lung cancers. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

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