Basic Information

Symbol
BNC2
RNA class
mRNA
Alias
Basonuclin Zinc Finger Protein 2 BSN2 Bn2 Zinc Finger Protein Basonuclin-2 Basonuclin 2 FLJ20043 LUTO
Location (GRCh38)
9:16409503-16870902
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017637.6
Sequence length
12808.0 nt
GC content
0.4174

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3578.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3829.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3577.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001317939.2 NCBI
ACUUGACAACCAGCAUGCCGAGAUGUCAGAAGAGGCAGAAGUGGAUGUG… 12738 nt 0.4169
NM_001317940.2 NCBI
ACUUGACAACCAGCAUGCCGAGAUGAUUGCCUGGUUUUCUCUGGAAUUC… 12588 nt 0.4155
NM_017637.6 NCBI
ACUUGACAACCAGCAUGCCGAGAUGGCACACCUUGGGCCCACCCCACCU… 12808 nt 0.4174
Summary

This gene encodes a conserved zinc finger protein. The encoded protein functions in skin color saturation. Mutations in this gene are associated with facial pigmented spots. This gene is also associated with susceptibility to adolescent idiopathic scoliosis. [provided by RefSeq, Jul 2016]

Forensic Context

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