Basic Information

Symbol
UTY
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitously Transcribed Tetratricopeptide Repeat Containing, Y-Linked KDM6C KDM6AL Ubiquitously-Transcribed Y Chromosome Tetratricopeptide Repeat Protein Ubiquitously Transcribed Tetratricopeptide Repeat Gene, Y Chromosome Ubiquitously Transcribed Tetratricopeptide Repeat Gene, Y-Linked Ubiquitously-Transcribed TPR Protein On The Y Chromosome [Histone H3]-Trimethyl-L-Lysine(27) Demethylase UTY Histone Demethylase UTY Ubiquitously Transcribed TPR Gene On Y Chromosome Ubiquitous TPR Motif Protein UTY EC 1.14.11.68 EC 1.14.11 UTY1
Location (GRCh38)
Y:13234577-13480673
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001258249.2
Sequence length
6174.0 nt
GC content
0.3931

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1665.11 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1785.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1412.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001258249.2 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 6174 nt 0.3931
NM_001258250.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6106 nt 0.4009
NM_001258251.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6574 nt 0.4031
NM_001258252.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6661 nt 0.4047
NM_001258253.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6403 nt 0.4047
NM_001258254.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6118 nt 0.4039
NM_001258255.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6289 nt 0.4023
NM_001258256.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6490 nt 0.4063
NM_001258257.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6154 nt 0.4006
NM_001258258.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6682 nt 0.4030
Showing 1 to 10 of 40 entries
Summary

This gene encodes a protein containing tetratricopeptide repeats which are thought to be involved in protein-protein interactions. The encoded protein is also a minor histocompatibility antigen which may induce graft rejection of male stem cell grafts. A large number of alternatively spliced transcripts have been observed for this gene, but the full length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Apr 2012]

Forensic Context

A study in human samples demonstrated that the UTY is a male-specific gene located on the Y-chromosome [van den Berge et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2016.10.018].