Basic Information

Symbol
UTY
RNA class
mRNA
Alias
Ubiquitously Transcribed Tetratricopeptide Repeat Containing, Y-Linked KDM6C KDM6AL Ubiquitously-Transcribed Y Chromosome Tetratricopeptide Repeat Protein Ubiquitously Transcribed Tetratricopeptide Repeat Gene, Y Chromosome Ubiquitously Transcribed Tetratricopeptide Repeat Gene, Y-Linked Ubiquitously-Transcribed TPR Protein On The Y Chromosome [Histone H3]-Trimethyl-L-Lysine(27) Demethylase UTY Histone Demethylase UTY Ubiquitously Transcribed TPR Gene On Y Chromosome Ubiquitous TPR Motif Protein UTY EC 1.14.11.68 EC 1.14.11 UTY1
Location (GRCh38)
Y:13234577-13480673
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001258249.2
Sequence length
6174.0 nt
GC content
0.3931

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1665.11 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1785.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1412.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001258269.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6394 nt 0.4026
NM_001258270.1 NCBI
GCUCAUCGUUUGUUGUUUAGAUAAUAUCAUGAACUGAUAAAUGCAGUUG… 6169 nt 0.4004
NM_001400170.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 5452 nt 0.4474
NM_001400171.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 5407 nt 0.4463
NM_001400173.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 5317 nt 0.4465
NM_001400175.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 6038 nt 0.3945
NM_001400177.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 6108 nt 0.3936
NM_001400178.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 6033 nt 0.3928
NM_001400181.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 5813 nt 0.3919
NM_001400183.1 NCBI
AGUCGCCUAGAUUGGCUACAACUAAGUGGUUGGGAGCGGGGAGGUCGCG… 3979 nt 0.4413
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Summary

This gene encodes a protein containing tetratricopeptide repeats which are thought to be involved in protein-protein interactions. The encoded protein is also a minor histocompatibility antigen which may induce graft rejection of male stem cell grafts. A large number of alternatively spliced transcripts have been observed for this gene, but the full length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Apr 2012]

Forensic Context

A study in human samples demonstrated that the UTY is a male-specific gene located on the Y-chromosome [van den Berge et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2016.10.018].