Basic Information

Symbol
VASH1
RNA class
mRNA
Alias
Vasohibin 1 KIAA1036 Tubulinyl-Tyr Carboxypeptidase 1 Tyrosine Carboxypeptidase 1 Tubulin Carboxypeptidase 1 TTCP 1 EC 3.4.17.17 Vasohibin-1 VASH
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_014909.5
Sequence length
6449.0 nt
GC content
0.6006

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2856.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2964.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1484.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((..((.(((..((.((((((((((((.((((((.(((.((((.(((((((((((((((..((((((((.((((((((((..(((((....((((((((((.((.(.(((.((((((.((((....((..(.(((((.((((((((((.((.((((.....)))))).)).))))))).)...))))).)..))......))))))))))..))))))))).)))))))(((((.(((..(((((..((((.....((.(((.(((..((((((....((((((.......)))).))...))).)))..))).))).)).....))))..)))))))))))))..)))))..)))))))))).......(((.(((....))).)))((((...((((((.((....)).)))..)))..)))).))))))))..)..)))))))))..))))).)))).))).)))))).)(((((((((((...)))).))).))))...))))))))))).)).))))).))).)))))...(((..(((((((((((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((..(((((..(((.(((.((((((....)))).)).)).).)))..)))))((((((....))))))..))))))).)).))).))))))))((((.((((((.(((((((((((.....(((((((((((.((.(((((.(((((..((.(((((...((((..(((..(((((...(((......)))....)))))))).))))))))).))..))))))))))))))))))))).))....((....))..))))))))))).)))))).))))))))).)))))(.(((((((...))))))).)......))).))).))).))))))))))..))).(((((...(.(..(((((((((((.((.(((((((.(((((((...(((((((...((((((((((..((((((((((((((((.((.((((.(((((((.(((((.((((.....((((((((((((.......((((.(((..(((((.((.((((.((((.....(((((......)))))..((.(((((((.(((((((((((....((........)).................(((((((((.......))).))).)))..........((((.((...)))))).........((((..(((((((.(((((....(((.......)))))))).)))))))..))))......(((((.((.(((((((.(((....((.(((.............))).))..))).))))))))).)))))(((((((((.(((((((.((.........))))))))).)))))).)))..))))))))))).)..)))))).))...))))))))..)).))))).....)).).)))).((.(((((((((((......(((.((...)).)))..))))))))))).))..(((((((((((...((((((.(((((...(((((((..((..(((....)))((((.......))))...(((((...(((.((((((((..(((((....((((.........))))..)))))..........)))))).)).)))...)))))......(((((((((((........))).((((((.((.......)).))))))...........))))))))..(((((((........)))))))......((..((((..((((((.(..((((..((......)).....))))..))).))))....))))..))))....)))))))......))))))).))))...))))))))))))))))..)))))))((((((...((((.(((.....((((....))))..........((((((.(((......((((((.(((((((((((((((.......)))))))....)))....))...))).))))))......))).))))))((((.((((((((.(.....(((((....)))))...))))))))).))))))).))))))))))((.((((.((((.((.((((.((.((((.((.....))....((((((....)))))))))).)).)))))))))))))).))))))(((...(((((.(..((.((.(((...)))))))..).))))).))).....)))))...)))))))(((((((.((((((...((...((((((((....)))))))))).....(((((((((((.(((((((((.((.(..((((((((((....(((((((((.((((........((((......((((.((((((((((((((....(((((.....)))))))))))(((.((((.(..((.(((((((...........)))))))))..).)))).)))((((....)))).........(((..((((((((((((.(((......(((((((((((.((((..((.((.(((((((..(((.((((((...((((((((..((((.((.(.((..((((((((......(((((....((((((((((.((((((((((((((((..(((.....((........))......)))))))))....))))))))))..))))))))))....))))).((.....))....(((((...)))))((((.((((((.......((((((((((((((((....(((.((((((((((....)))))))))).)))...)))))))))))......))))))))))).)))).....))))))))..)).).)).((((((....))))))((((((((......)))))))).........))))..))).)))))((.(((...))).))......((((((((((((((........)).)))..)))))))))...(((((((..(.(((((..((((((((((((((.(.(((....))))))))))....)))))))).))))).)..))))))))).)))))))..)).))))..((((((((......))))))))...........).)).))..)))))))).))))))).)))))))))))))))....))).((((....))))((((....))))(((((((((.....))).)))))).((((......)))))))))))).))))))))......)))).))).))).))).....))))))))))..).)).))))..))))).))))...)))))))((((.((((.((..((...((((((.(((((..((((...........)))).....((((((.(((((.((((.((((((.(((((.((...((((((...........)))))).)).)))))..))).)))...)))).))))))))))))))))))))))(((......))).((((.((((((....))))))..)))).))..))..)))).)))).)))))).)).).))))..)))).))))))))))))))..)))).)))))..))))).....(((.(.....).))).......((.(((...))).)))))))))))))))).)).))))).)).))).....))))))))..).)((((((((((((((.........)))))........((....)).(((((((.((.(((((((((((((......))))))).(((((...(((((((((((.....)))).((((((((((((((((.((((.....))))..((((((((((..((((((...(((....))))))))).))))))))))....(((((((.(((..((.(((((.......((((..((..((((....((((....(((.(((....(((((((.(((..(((((((((((((((((.((((.(((((.(((.((.((((....)))).))..))))))))..((((((..((((((((((.......((((((((.(((((((((((........(((((((.......)))))))((((((.((((..(((.(((....))).)))....)))).)))))).............)))).)))))))((((((.(((......))).(((((..(((((((....))).)))))))))..((((((.......(((((((((((((((.......)).)))))..))))))))))))))(((((..(((..(.((((.((..(((.((((((((...((...))...))))))))))).)))))))..)))...))))).........(((((....)))))(((((((((((((((((.(((((.(((((.((....(((((...(((((((.(((((((.(((((.......)))))..((((((((..((((.((...((((((.(((((.((.....))))))).)))))).(((((((.((((..(((((((..((((((((((((......))))..((.(((((.((((((..((((.......)))).)))))))))))))(((((((.(((((.......(((.((((((((......)))))))).)))(((((..((...((((((((((.....(((((((((((.((((....(((.(((..((((((((........)))).))))))))))..)))).))))))))))).....((((((..(((....)))..))))))....(((((....(((((..(((.((((((((.......(((.(((...((((((.(((((...))))).))).))).))).)))..)))))))).)))..)))))((((((..((.(((((((((((.((((((((.((((((((.(.....(((((.(((........))).))))))))))))))((((.((.(((...(((((......(((........))))))))))).))..)))))))).)).))))).((((.........))))...(((((((((((.((((.(.(((((......))))).))))).)))))...)).))))....(((((......))))).....)))))))).))....))))))....(((((.(((((.((((....))))..))))).))))))))))))))))).)))......))..)))))..))))))))))))..(((((....(((((((.(((.(((....(((..((((((.....))))))...))))))))).))..)))))....)))))(((((.((((((((((.....))).)))).........))).))))))))))))).)))))))..)))).....((((......)))).)))))))........)).))))...((((.((((....)))).))))...(((((((((((((((.((..((((...)))))).)).))))))))))))).......)))))))).........)))).))))))))))...)))))...))))))).)).)))....)))......)))))..)))))))))...))))))...))))))))....)))))))))))))))).(((((((((((((.(((.........)))..)))))))))))))(((((.............))))).))))..))))).........)))))))))...((((((.......))))))....)))..))).)))))))...))).)))))))))))..))..)))).....))))))).))))))))))..(((((((......(((((..((((((((((..((((((.((((......(((((..(((((.((((.(((.......))).)))).)))))...)))))((((.((((.......))))...))))((((.....)))).(((.((((((((((((((((((...)))))((....))..((((((((.((.....(((((....(((((((..((((.(..(((((....((((.........))))....)))))..))).))..)))))))....)))))((((.(((((.(((((.((...........)))))))))))).)))).......(((((...))))).)).))))))))))))))))))))).))).))))))))))))))))))..))..))))).....)))))))...))))))))..)).))))))..))))))).)))))......))))))..))))))))).)))))))))...........(((((.(.((((....)))).).))))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((.,((.(((..((.((((((((((({.((((((.(((.((((.(((((((((((((({..((((((((,(((((((((({,(((((,..{((((((((((.((.{.(((.((((((.((((....((..(.(((((.((((((((((.((.((((.....)))))).)).))))))).)...))))).)..))......))))))))))..)))})))))}}))))))|(((({(((..,,|||}}|||{.....((.{{|,{({..{,{{,,..,,{{.,|,.,}}},.}}}},,)||}|}|,}},..))).|||{|}...,,)))),,)))))))))))))..))))),.)))))))))).,..,,,(((.({(....})),))){{{{...{||||{.{{,...}}.})),|))}..}}}).))))))))..}..))))))))),.})))).)))).))).)))))).,,{||||{|(((|,,|,}}.}})}))))}..))))))))))).)).))))},))).))))).,{(((..(((((((((((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((..(((((..(((.(((.((((({....}))).)).)).).)))..)))))((((((....))))))..))))))).)),})).))))))))((((.((((((.(((((((((((.....,((((((((((.((.(((((.(((((..((.(((((...((((..(((..(((((...(((......)))....)))))))).))))))))).))..))))))))))))))))))))),,}....{|....}}..))))))))))).)))))).))))))))).))))){.(((((({...})))))).,......))).))).))).))))))))))..)))|,.,,,...,.,..(((((((((((.((.(((((((.(((((((...(((((((...((((((((((..(((((((((((((((((((.((((.(((((((.{((((,((((,,,..((((((((((((.......((((.(((..(((((.((.((((.((((.,,,.((((,..,,},,))),..((.((((((({(((((((((((....{{..,,....)).................(((((((((.......)))}})).))}........{{((((((({.{({{,|,.........,))}},(((((((.(((((..{(((........)))))))).))))))).))}})))))))(((((.((.(((((((.(((....((.{{(,,{.........,))).))..))).))))))))).)))))(((((((((.(((((((.{..........),))))))).)))))).)))..))))))))))).).,)))))).))...))))))))..)).))))).....)).).)))).((.(((((((((((....,.(((.((...)).)))).))))))))))).))..(((((((((((...((((((.(((((...(((((((..{{{((((....))))|(((({.(.((((,{,,(((((...(((.((((((((.{(((({.,{{(((,.........})))..))))),,.....,..)))))).)).)))...)))))......(((((((((((........))).((((((.((.,....,)).)))))),,.......,.))))))))..(((((((........))))))),,.,,.,,...,))},,|.)))),,)))))..((......)).....(((,..}||,..,,...}}}}}}..}))....)))))))......))))))),})))...))))))))))))))))..)))))))((((((,..{(((.{{{....,(((,....}))).,.......,((((((.(((......((((((.((({{((((((((((,{....}))))))),...}))....}}...))).))))))......))).))))))((((.((((((((.{.....(((((....))))).,.})))))))).)))),}).))))))))))((.((((.((((.{(.((((.((,(({{.{(.....))....((((((....)))))))))).)).)))))})))))))).))}}}},||,..(((((.(..((.((.(((...)))))))..).))))).,},....,})),..,.)))))))(((({((.((((((...{{...((((((((....)))))))),,....,{((((((((((.(((((((((.((.{..((((((((((....(((((((((.((((........(((({,,...({{{.((((((((((((((....(((((.....))))))))))){(({{{,{,||.{{.{{(({(({{{,.......,,,))))))}.||,|||.}|}|{|||..||||||{,..{{,.{({,.((((((((((((.({{..,,,.(((((((((((.((((..((.((.(({((((..(((,((((((...((((((({{{((((.({.{.((..((((((({.,....(((((....((((((((((.(((((((((({({(({..((({,..,((........})}}...,))))})))}..,.))))))))))..))))))))))....))))).|{.....||....{({{{..,||}}|((((.(((((((....,.{{{(((((((((((((....(((.((((((((((....)))))))))).)))...)))))))))))......))))))))))).)))),,,},))))))))..)),),)),{(((((....)))))}((((((((......)))))))}{{{..,.},))},..))),,))))}}}||{,...,}.},,.,...((((((((((((((........)).)))..)))))))))...((((((({,{.(((((..((((((((((((((.(.(((....))))))))))....)))))))).))))).)}.))))))))).)))})))..)).))}}..((((((((......))))))))..........,}.)).))..)))))))).))))))).)))))))))))))))..,,||,.{(((,...}}}}||||,,},})))|||||||||}},,,,)).}))}},.{(((......)))})))))))).))))))))......)))).))).))).))).....))))))))))..}.)).))))..))))).))))...))))))|((((.((((.((..{{..{((((((.(((((..((((...........)))).....((((({{(((((.((((.((((((.(((((.,{...(((((({........}})))))).}}.)))))..)))},))...)))).))))))))))))))))))))))|((......))).((((.((((((....))))))..)))).))..))..)))).)))).)))))).)).).))))..)))).))))))))))))))..)))).))))}..))))).....(({.(.....,,))).......((.(((...))).)))))))))))))))).)),,)))).)).)))}....}))))))}.,|{,(((((((((.,{{{,.{,,{{{{|||||{{.||,...,.,,,))}{{|||||.{{.(((((((((((((......))))))).(((((,{.((((((({(({.....}})}.((((((((((((((((.((((.....)))}..((((((((((.,((((((...(((....})})))))).)))))))))).((((.{(((.,(((((((((((..,,((,((((((...,{((((((({{((((.......))))...,,(({({{{{..(((((((({(((,({{((((,{({.(((((.(((.((.((((....)))).))..)))))))).))|).),)))),)))))).))}.))){{{(((,{.{{({{(((,,{,||,,...((((((|.......)))))))((((((.((((..(((.(((....))).)))....)))).)))))).............}}},{||||||....,,,.})))))))))}}}.|||||,{{{.{{{..{{|||(((((((((.((.(((......,,.,{{{{((((((((((.......)).))})),}),}))||(((((((.((((((((.((((((({{((({(((.((((((((...((...))...))))))))))).,,(((((..,{(((,{{(({{,,,,..,{(((((....)))))}||{|{(({{{..((((((((.....)))||)))}{{|||{.||((({...,....,|{{((((({..,,.....,{{((((.,(,(({..{{,(((.(((((((.(((((,,(.....})))))).))))))|||.,.}}})),).,)})}}}....,{||...}}}},..{{{|.(((({..,,,.,.}))})))),}}}))))})))))).))))))})))))}.})))),})))}}}}}..,,|||{(({((({(,...,,})))}))).|||.((({..(((((((((((((((,,{..(((((((((((.((((....(((.(((..((((((((........)))).))))))))))..)))).))))))))))).....{{,,,,..(((.,|||||.,||||||{{{{(({,{.{{.,,,||.}|||}||||||||}}}}}..(({.|||},{((((((.(((((...))))).|||.|||{|,|.,||{{|||,,|||{,,,..,)))).,)}})})),....}.})))),)))})))))))}..))))))}..)))))))))))...}))))))))))).)))),...((((((.((.(({..,(((((......{((........))))))))))).))..))))))}))).)))))})))),,,..))))))))))).{(({{{(((((.((((.{.(((({......))))).))))).)))))...}).)))),,..|{{{{......))}},))}))),)),,.))))))..}))),}}..}}}}..{(.(((((((((((((((((((((((((((((.((({{((((.((({(({....((((({,(((((((((((((.((((((((,....|,,((({....})))..........(((((.....))))){((.((((,{((((.(.((((((.(((((..((((((.((((((((((.....))).)))).........))).))))))..)))))...(((((((.((.((((,{(((......)))))))).{((........)))..{((((((((,,,,,....},)))))))},.(((((((((((((((.((..((((...))))}}.)).))))))))))))).....)).))))))))))))).).))))))))).,)))})))))).))))))...))))).))))))))..}})),)))}))))))))))))),,(((({.{{{.{{,,,)|,.}}}.}))}|,.|,..,,||{({(((((((((((.(((.........)))..))))))))))))).,||{|||||}}|,.,,(({,.({{,{{{{{....,,}||}}}}..}},|}}}||,|||||{({{((((|.,,}))))}}}|||,,.}}))).,)))))|{((((....)))))).})))))))))))))))).)}.)))),,,,,|,(((({{(..|,..{((((,.{{{(((((((..,,,,,((((((((((.{.(.,,...,,}.},)))))))))),,{.,||,||)),,|,..{{{,||||(({(.{(((.....},)})},.,||||.{,...,.})))).(((.(((((((((((({(((({...})))){|{{..|{{{((((,((,{((((((.,{{,....,},,,.))))))}..)).}))))})}.}},|...,,{{{{{{.|,,,,||||....|{{{{....,||,,..,,)))}}((((.(((({,(((((.{{...,,|....,)))))))))))).))))...,|,.(((((...))))).)))),))))))))))))))))))).))).)))))),)))))))))}).,))..)))))...,,)))))))...))))))))..)).))))))..))))))),)))))......)))))).,)}))))))}.)))))))))...........,,(((.({((((..{{||,,.)})))))))),)}}...},}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCGGGCCGUAGUCGAGCCUGGUGGGCGGCUGGCUGGCAGGGGACGUGGU… 6449 nt 0.6006
Summary

Enables actin binding activity and metallocarboxypeptidase activity. Involved in negative regulation of angiogenesis; negative regulation of blood vessel endothelial cell migration; and proteolysis. Acts upstream of or within several processes, including negative regulation of endothelial cell proliferation; negative regulation of lymphangiogenesis; and regulation of cellular senescence. Located in apical part of cell; endoplasmic reticulum; and extracellular space. Implicated in liver cirrhosis and portal hypertension. Biomarker of liver cirrhosis. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human postmortem prefrontal cortex demonstrated that the VASH1 was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].