Basic Information

Symbol
BNIP3L
RNA class
mRNA
Alias
BCL2 Interacting Protein 3 Like BNIP3a Nix BCL2/Adenovirus E1B 19 KDa Protein-Interacting Protein 3-Like BCL2/Adenovirus E1B 19 KDa Protein-Interacting Protein 3A BCL2/Adenovirus E1B 19kDa Interacting Protein 3 Like NIP-3-Like Protein X NIP3-Like Protein X NIP3L BCL2/Adenovirus E1B 19-Kd Protein-Interacting Protein 3a Adenovirus E1B19k-Binding Protein B5 Adenovirus E1B19K-Binding Protein B5 BNIP3A BNIP3H NIX
Location (GRCh38)
8:26383037-26505636
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004331.3
Sequence length
3452.0 nt
GC content
0.3737

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-862.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -934.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 893.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330491.2 NCBI
GUAGCUGAUGUGCAGUUGUUUCUGCUCCCAAAUCAACAGGGUUUAAUGA… 3380 nt 0.3609
NM_004331.3 NCBI
GGACUCGGCUUGUUGUGUUGCUGCCUGAGUGCCGGAGACGGUCCUGCUG… 3452 nt 0.3737
Summary

This gene encodes a protein that belongs to the pro-apoptotic subfamily within the Bcl-2 family of proteins. The encoded protein binds to Bcl-2 and possesses the BH3 domain. The protein directly targets mitochondria and causes apoptotic changes, including loss of membrane potential and the release of cytochrome c. [provided by RefSeq, Feb 2015]

Forensic Context

A study in human cadavers demonstrated that the apoptotic thanatotranscriptome in liver tissue shows significant postmortem changes, with the BNIP3L being down-regulated by -8884.3565 fold in decaying tissues compared to a 6-hour control, indicating its role as an apoptosis-related gene whose expression is markedly suppressed during decay [Javan et al. DOI:10.1007/S12024-015-9704-6].