Basic Information

Symbol
BPI
RNA class
mRNA
Alias
Bactericidal Permeability Increasing Protein BPIFD1 Bactericidal Permeability-Increasing Protein BPI Fold Containing Family D, Member 1 CAP 57 Bactericidal/Permeability-Increasing Protein Recombinant BPI Holoprotein, RBPI RBPI
Location (GRCh38)
20:38260141-38337505
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001725.3
Sequence length
1841.0 nt
GC content
0.5182

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-602.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -634.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 606.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001725.3 NCBI
CUUUUAUAGCUCCCUGGUUCAACCUCAAGGCCUUGAGGUUUUGGCAGCU… 1841 nt 0.5182
Summary

This gene encodes a lipopolysaccharide binding protein. It is associated with human neutrophil granules and has antimicrobial activity against gram-negative organisms. [provided by RefSeq, Nov 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.